计算化学公社

标题: 求助过渡态结构是否可直接用构型搜索 [打印本页]

作者
Author: qjy111 时间: 2023-4-1 17:00
标题: 求助过渡态结构是否可直接用构型搜索
过渡态搜索中的过渡态结构，如吸收二氧化碳，可不可以通过对阴离子，阳离子，CO2直接进行生成团簇，利用molclus进行构型搜索得到最稳定结构，文献中大部分是进行二面角势能扫描

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-4-1 17:12
这样搜出来的是反应复合物的构型，不是过渡态的构型。过渡态一般要冻结某些键长再搜索，参见https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.9b13725

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-2 04:05
molclus的settings.ini里通过freeze可以设置批量优化过程中冻结哪些原子。可以先对一种结构手动找过渡态，把反应区域原子坐标以这种方式冻结住，再令其它部分变化来搜索。

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