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标题: Gaussian优化罗丹明B离子化合物后体系中阴阳离子连起来了，这正确吗？ [打印本页]

作者
Author: adreamy 时间: 2023-4-3 17:09
标题: Gaussian优化罗丹明B离子化合物后体系中阴阳离子连起来了，这正确吗？
如我在优化罗丹明B（下图）时，优化结束后氯离子和氮离子自动用单键连接起来了，这种情况对不对？

作者
Author: 牧生 时间: 2023-4-3 17:37
优化离子结构就行，不需要那个CL，然后把总电荷设为1就行

此外，羧基的氧原子太靠近那个碳，有可能导致优化后的结果不可靠。因为这个结构应该不会是一个平面结构，所以最上面的环状可能与下面的平面结构呈一定夹角。所以，解决方法，把那个羧基拖成直的结构，使氧原子朝上，各个原子距离既不太远，又不太近，优化后，结构就应该合理了。

作者
Author: adreamy 时间: 2023-4-3 17:39

牧生发表于 2023-4-3 17:37
优化离子结构就行，不需要那个CL，然后把总电荷设为1就行

此外，羧基的氧原子太靠近那个碳，有可能导致 ...

好的，谢谢老师

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-4 06:50
提问时能上传输入文件的时候尽量上传，否则有硬伤别人也不知道，诸如没考虑溶剂模型、初始构型不合理等

另外看此文
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414（http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html）

作者
Author: adreamy 时间: 2023-4-5 20:16

sobereva 发表于 2023-4-4 06:50
提问时能上传输入文件的时候尽量上传，否则有硬伤别人也不知道，诸如没考虑溶剂模型、初始构型不合理等

...

谢谢sob老师提醒，问题已经解决了。

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