计算化学公社

标题: CP2K算非周期体系结构时是否可以对结构进行约束？ [打印本页]

作者
Author: learn-GAUSSIAN 时间: 2023-4-4 12:51
标题: CP2K算非周期体系结构时是否可以对结构进行约束？
本人是CP2K新手，想利用CP2K跑分子动力学。我想请问一下，CP2K是否可以对非周期性体系进行结构约束，就是把结构约束在一个充满水的球形当中，而不是使用盒子。还望各位不吝赐教！谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-4 13:02
看不懂你的目的是什么，也没体系的任何特征描述，没法告诉你怎么实现合理。

作者
Author: learn-GAUSSIAN 时间: 2023-4-4 17:15
因为我的.cif文件很复杂，所以我想从中截取出一个小片段，将这样一个非周期性的分子结构进行约束处理（为了不让它跑出去）。然后用cp2k跑第一性原理分子动力学来实现它对水同位素的吸附过程。主要是想知道cp2k能不能实现对非周期性结构的约束

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-5 06:58

learn-GAUSSIAN 发表于 2023-4-4 17:15
因为我的.cif文件很复杂，所以我想从中截取出一个小片段，将这样一个非周期性的分子结构进行约束处理（为了 ...

照常用冻结设置，对周期性和非周期性都完全一样

作者
Author: learn-GAUSSIAN 时间: 2023-4-5 09:51

sobereva 发表于 2023-4-5 06:58
照常用冻结设置，对周期性和非周期性都完全一样

谢谢老师

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