计算化学公社

标题: 求助：Dimer与Improved Dimer Method（IDM）哪个方法更好？ [打印本页]

作者
Author: 阿司匹林泡腾片 时间: 2023-4-6 20:23
标题: 求助：Dimer与Improved Dimer Method（IDM）哪个方法更好？
本帖最后由阿司匹林泡腾片于 2023-4-12 08:57 编辑

教程比较少，在官网有Dimer和Improved Dimer Method（IDM）方法的简单介绍，公社里也有相关的一个帖子。看名字似乎IDM方法更好一点，计算也简单，但我不太熟悉，特向大家请教一下哪个方法更好一些。
第二个问题就是，在做IDM计算的时候可不可以固定POSCAR内部分原子的坐标？（因为后边需要加振动计算得到的dxdydz部分，所以我拿不准这个，固定的话，后边dxdydz那要不要固定呢？）。
第三个问题是，有没有前辈尝试过加隐式溶剂计算IDM？（参数：LSOL = .TRUE. EB_K = 80等）对于结构和能量的影响大不大呢？（或者求过渡态的时候不加隐式溶剂，仅过渡态后的scf加溶剂？）

作者
Author: nosugar 时间: 2023-12-22 10:05
你好，最近也在用IDM跑过渡态，但是结构一直跑散，请问您有遇到过这个情况嘛？

作者
Author: 123wo 时间: 2023-12-22 10:17

nosugar 发表于 2023-12-22 10:05
你好，最近也在用IDM跑过渡态，但是结构一直跑散，请问您有遇到过这个情况嘛？

加1，所以我又回到dimer那里了，后面受力直接离谱了。但是我一个同门的体系用这个IDM计算起来又快又准。不知道这个是看人还是看体系

作者
Author: nosugar 时间: 2023-12-22 11:33

123wo 发表于 2023-12-22 10:17
加1，所以我又回到dimer那里了，后面受力直接离谱了。但是我一个同门的体系用这个IDM计算起来又快又准。 ...

我服了，我用这个方法跑现在的体系就没跑出来过

作者
Author: nosugar 时间: 2023-12-22 11:35

123wo 发表于 2023-12-22 10:17
加1，所以我又回到dimer那里了，后面受力直接离谱了。但是我一个同门的体系用这个IDM计算起来又快又准。 ...

你好顺便问一下，跑Dimer的话想要自己写MODECAR，但是我在官网并没有找到格式文件，方便问一下MODECAR要怎么写嘛？

作者
Author: 卡开发发 时间: 2023-12-22 11:58

nosugar 发表于 2023-12-22 11:35
你好顺便问一下，跑Dimer的话想要自己写MODECAR，但是我在官网并没有找到格式文件，方便问一下MODECAR要 ...

MODECAR那个输入不是VASP原生存在的，是用VTST tools插件的时候用到的。链接的Dimer calculation setup的第4点你可以仔细看看，这种方法理论上可以不需要Hessian信息。

作者
Author: nosugar 时间: 2023-12-22 16:14

卡开发发发表于 2023-12-22 11:58
MODECAR那个输入不是VASP原生存在的，是用VTST tools插件的时候用到的。链接的Dimer calculation setup的 ...

感谢卡老师的解答，已经明白啦

作者
Author: 阿司匹林泡腾片 时间: 2023-12-25 15:54

nosugar 发表于 2023-12-22 10:05
你好，最近也在用IDM跑过渡态，但是结构一直跑散，请问您有遇到过这个情况嘛？

确实容易跑散，可能是参数的问题

作者
Author: wing 时间: 2024-3-13 16:52
请问一下我的idm为什么会跑到能量更小的地方去了，参数应该怎么设置？

作者
Author: qzy07 时间: 2024-7-9 22:30

阿司匹林泡腾片发表于 2023-12-25 15:54
确实容易跑散，可能是参数的问题

您好，我的是有的可以跑出来，有的就跑散了，有什么解决办法吗，或者调哪个参数求指教

作者
Author: qzy07 时间: 2024-7-10 11:37

卡开发发发表于 2023-12-22 11:58
MODECAR那个输入不是VASP原生存在的，是用VTST tools插件的时候用到的。链接的Dimer calculation setup的 ...

老师好！我的过渡态精算的时候dim很难跑出来，IDM是有的可以跑出来，有的就跑散了，有什么解决办法吗，或者IDM调哪个参数求指教,谢谢老师！

作者
Author: 卡开发发 时间: 2024-7-10 20:45

qzy07 发表于 2024-7-10 11:37
老师好！我的过渡态精算的时候dim很难跑出来，IDM是有的可以跑出来，有的就跑散了，有什么解决办法吗，或 ...

实在不行就NEB算到收敛。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)