计算化学公社

标题: 如何利用tcl结合VMD处理长轨迹的性质 [打印本页]

作者
Author: wangyueda 时间: 2023-4-12 14:57
标题: 如何利用tcl结合VMD处理长轨迹的性质
请问下各位老师，如何利用tcl结合VMD处理长轨迹的性质？利用gmx模拟得到的xtc轨迹中含有10000帧结构，利用tcl语言结合VMD分析体系的相关性质，但是直接载入10000帧结构轨迹的话运行内存不够，请问如何在保留原有帧数的前提下解决类似问题？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-12 17:48
如果用的32bit VMD 1.9.3，换公社论坛里64bit VMD 1.9.3。如果是内存不够，找个内存大的机子。
也可以分段处理轨迹，每次只载入轨迹的一部分，算完了删除所有帧。反复如此，最后合并结果。

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