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标题: dimer找完过渡态之后的振动方向不是我预期的，这是为什么 [打印本页]

作者
Author: fight 时间: 2023-4-12 15:48
标题: dimer找完过渡态之后的振动方向不是我预期的，这是为什么
我使用vasp做过渡态经验<二>：Dimer - 第一性原理 (First Principle) - 计算化学公社 (keinsci.com)该帖子给的方法寻找过渡态。我给出一个初猜结构，计算频率,虚频显示 (, 下载次数 Times of downloads: 13) ，413.081281 cm-1虚频对应的振动模式是我设想的该反应发生的成键方向，于是我使用413.081281 cm-1的振动频率制作了MODECAR，dimer之后，再次验证虚频的时候，唯一虚频对应的振动方向竟然是初猜结构的225.127914 cm-1（即上图的倒数第二行）。和我预期的过渡态成键方式不一样，请问各位大佬出现过这种情况吗?该如何解释？

作者
Author: ahxb 时间: 2023-4-12 17:11
正常，特别是初始结构不太好的时候。
如果结构是自己随手搭的，考虑按照你给的帖子里的做法，先跑个粗糙的CI-NEB。
如果已经这么做了，考虑在CI-NEB计算中尽量多地固定反应区域外的原子，可以固定全部表面原子。低精度的计算有时会较大程度影响表面结构。也可以考虑适当增加CI-NEB计算的精度。

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