标题: gromacs的plumed插件bias-exchange metadynamics设置求助 [打印本页] 作者Author: tangzi_via 时间: 2023-4-13 16:02 标题: gromacs的plumed插件bias-exchange metadynamics设置求助 如何设置双重偏置副本交换中的plumed.dat文件各位前辈你们好，请教大家一个问题
我想做一个双重偏置的副本交换，在plumed手册里面讲到Bias-exchange metadynamics的设置，
ARG=@replicas:phi,psi,phi
在ARG=@replicas:phi,psi,phi，在这句话里第一个phi没有加粗，是不是进行没有偏置的设置，后面两个是进行偏置的设置？那这样第三个副本没有偏置是如何体现出来的？
HEIGHT=__FILL__ # make sure that there is no bias on the third replica!
而这个hight后面提到确保第三个副本是不设置偏置的，应该如何具体体现出来？是不是直接设置HIGHT=1就可以了？但是这样的话怎么体现第三个没有偏置呢？
才开始学习plumed，有很多基础都还不懂的地方，希望各位前辈能提出宝贵的意见，再次感谢各位
