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标题: 用ONIOM方法优化蛋白结构输出文件大小太大 [打印本页]

作者
Author: yjb 时间: 2023-4-14 01:28
标题: 用ONIOM方法优化蛋白结构输出文件大小太大
各位老师好，最近需要用的ONIOM方法优化蛋白结构过渡态，蛋白活性位点区域100个原子，MM区域有14000多个，用的方法是#T opt(calcfc,ts,noeigen) oniom(b3lyp/6-31G*:amber=hardfirst) geom=connectivity ，优化完结构之后正常收敛，需要做频率分析，发现输出文件大小有3GB，无法用gv打开，查看虚频确实是只有一个负值，但是需要查看他的振动是否正确。有没有什么方法可以让输出文件把没有用的东西都不要输出，可以让gv能够正常打开。

作者
Author: XiaoYan 时间: 2023-4-14 16:25
3GB是可以打开的，等十来分钟，或者你把read internal geometries 关掉，速度会快很多

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