计算化学公社

标题: 求助无定形硅到晶体硅的分子动力学模拟 [打印本页]

作者
Author: Shuang-Jie 时间: 2023-4-14 22:18
标题: 求助无定形硅到晶体硅的分子动力学模拟
想用Gromacs模拟无定形硅在高温高压退火后转变为晶体硅的过程，请问无定形的单质原子怎么建模呢？以及找力场文件；求讨论指导.

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-14 23:17
这种问题用GROMACS不适合。没有GROMACS支持的了的力场能够同时较好描述晶态和无定形的Si
可以用CP2K在GFN1-xTB级别下跑MD，升温到高温，跑一阵子之后，自然就成了无定形了。顺带一提，北京科音CP2K第一性原理培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html）讲AIMD的部分专门有基于晶态SiO2跑出无定形SiO2的例子。
另外，reaxFF也许也能模拟，可以跑更长的时间尺度和更大的体系。

作者
Author: Shuang-Jie 时间: 2023-4-17 10:13

sobereva 发表于 2023-4-14 23:17
这种问题用GROMACS不适合。没有GROMACS支持的了的力场能够同时较好描述晶态和无定形的Si
可以用CP2K在GFN1 ...

谢谢Sob老师

作者
Author: ymeng 时间: 2023-12-28 10:48

sobereva 发表于 2023-4-14 23:17
这种问题用GROMACS不适合。没有GROMACS支持的了的力场能够同时较好描述晶态和无定形的Si
可以用CP2K在GFN1 ...

社长，请问纯金属Bi的amorphous建立过程也可以基于SiO2的过程做吗？得到的结构可以用来研究热力学的过程吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-29 04:32

ymeng 发表于 2023-12-28 10:48
社长，请问纯金属Bi的amorphous建立过程也可以基于SiO2的过程做吗？得到的结构可以用来研究热力学的过程 ...

可以

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