标题: VMD截取距离特定原子特定距离内的所有残基完整分子问题 [打印本页] 作者Author: Yura 时间: 2023-4-15 09:45 标题: VMD截取距离特定原子特定距离内的所有残基完整分子问题
想使用vmd截取轨迹中所有距离某个原子A，3ai距离以内的残基完整分子，
尝试使用 same residue as within of (name A),
发现在某一帧是可以正确截取的，但是使用vmd的save coordinate保存截取后的信息，发现只有第一帧是符合要求的，其它帧都还是保留了第一帧截取的残基分子。
求问这是为什么？以及该怎么解决？ 作者Author: sobereva 时间: 2023-4-15 19:55
保存轨迹时，选择语句仅对第一帧判断，之后每一帧都用第一帧判断的原子
这是必然的事，轨迹文件要求每一帧原子数必须相同，只有这样才能在用户使用了动态选区时绝对满足要求作者Author: Yura 时间: 2023-4-17 10:06
嗷嗷，好的，明白了，谢谢老师！