计算化学公社

标题: vasp中异质结进行静态自洽时，超算因堆栈或内存问题停止计算怎么解决？ [打印本页]

作者
Author: x先生 时间: 2023-4-17 15:25
标题: vasp中异质结进行静态自洽时，超算因堆栈或内存问题停止计算怎么解决？
计算环境：
            南京大学超算系统

            Intel(R) Parallel Studio XE 2020 Update 4 for Linux*
               vasp 5.4.4
计算目的：对异质结进行静态计算获得CHG文件和WAVECAR文件以进一步计算磁各项异性能
准备文件：结构优化得到的CONTCAR(现改名为POSCAR ),POTCAR,
            延用结构优化的KPOINTS文件（为减少计算时间并未增加k点数）
            INCAR文件（见附件）
            任务提交文件vasp_sub

运行指令：bsub < vasp_sub
运行日志：见附件
运行结果：自动中断，log和OSZICAR均没有报错信息

问题：
1，是否是内存泄漏导致的问题？
2，该问题该如何解决，在超算中并没有权限修改系统文件和安装补丁？

作者
Author: x先生 时间: 2023-4-17 15:27
再补一张OSZICAR的图片

作者
Author: WVzzz 时间: 2023-4-17 17:38
本帖最后由 WVzzz 于 2023-4-17 17:39 编辑

1.首先把ALGO换成N
2.上面不能解决的话就要考虑把2020的编译器换成2015的，具体看http://bbs.keinsci.com/thread-16082-1-1.html不过我认为大概率改变ALGO就能解决问题

作者
Author: xzzjl 时间: 2023-4-17 17:45
INCAR加入：

AMIX = 0.2
BMIX = 0.0001 #almost zero, but 0 will crash some versions
AMIX MAG = 0.8
BMIX MAG = 0.0001 #almost zero, but 0 will crash some versions

试试

我以前碰到过这样试了基本解决了

作者
Author: x先生 时间: 2023-4-17 22:08

xzzjl 发表于 2023-4-17 17:45
INCAR加入：

AMIX = 0.2

感谢您的回复，这个我确实还没有尝试过。但是在之前的小体系计算中，我遇到过磁矩的报错，当时就使用了这个方法解决的，但是后面发现该参数会对能带数量有影响，我这边也会尝试使用该参数进行计算，再次感谢您的回复

作者
Author: x先生 时间: 2023-4-18 09:02

WVzzz 发表于 2023-4-17 17:38
1.首先把ALGO换成N
2.上面不能解决的话就要考虑把2020的编译器换成2015的，具体看http://bbs.keinsci.com ...

感谢您的回复，已经尝试了使用ALGO = N来计算体系，目前计算步数已经超过了之前的计算

作者
Author: xzzjl 时间: 2023-4-18 10:53

x先生发表于 2023-4-17 22:08
感谢您的回复，这个我确实还没有尝试过。但是在之前的小体系计算中，我遇到过磁矩的报错，当时就使用了这 ...

客气了我也持续关注学习下

作者
Author: x先生 时间: 2023-4-19 10:08

xzzjl 发表于 2023-4-18 10:53
客气了我也持续关注学习下

目前使用ALGO = N成功计算了，但是体系比较难收敛，只能100步100步的计算，如果设置离子步太大就会出现磁矩的报错

作者
Author: xzzjl 时间: 2023-4-20 11:04

x先生发表于 2023-4-19 10:08
目前使用ALGO = N成功计算了，但是体系比较难收敛，只能100步100步的计算，如果设置离子步太大就会出现磁 ...

感谢回复学习了学习了~

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