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标题: 做蛋白-配体结合报错Group Protein_UNL在index文件中没有找到 [打印本页]

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Author: tiny 时间: 2023-4-17 16:18
标题: 做蛋白-配体结合报错Group Protein_UNL在index文件中没有找到
Group Protein_UNL referenced in the .mdp file was not found in the index file.Group names must match either [moleculetype] names or custom index group names, in which case you must supply an index file to the '-n' option of grompp.以下是我的md.mdp文件以及index文件，请各位老师指点，谢谢

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Author: t675210552 时间: 2023-4-17 21:03
输命令的时候加上“-n index.ndx”

作者
Author: tiny 时间: 2023-4-18 09:35

t675210552 发表于 2023-4-17 21:03
输命令的时候加上“-n index.ndx”

谢谢！问题解决了！

作者
Author: 长夜梦我 时间: 2023-7-7 19:34

t675210552 发表于 2023-4-17 21:03
输命令的时候加上“-n index.ndx”

您好，我想问一下，我加了-n index.ndx 这个参数，为什么还是会报这种错误。前面的步骤都是按照别人的流程走的

作者
Author: 长夜梦我 时间: 2023-7-9 09:18

长夜梦我发表于 2023-7-7 19:34
您好，我想问一下，我加了-n index.ndx 这个参数，为什么还是会报这种错误。前面的步骤都是按照别人的流 ...

找到错误了。自己偷懒少做了一步，用了人家现成的东西，结果配体现在更新了，少了几个原子

作者
Author: MOI_001 时间: 2024-1-23 19:47

t675210552 发表于 2023-4-17 21:03
输命令的时候加上“-n index.ndx”

你好，我加了之后报了下面的错要怎么解决啊？
Error in user input:
Invalid command-line options
In command-line option -n
Option specified multiple times

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