计算化学公社

标题: 柠檬酸铜的结构不合理，该如何调整? [打印本页]

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2023-4-18 10:01
标题: 柠檬酸铜的结构不合理，该如何调整?
各位老师好，我用Gaussian结合B3LYP/SDD（Cu） 6-31+G**（C H O）优化柠檬酸铜这个分子，优化完一个CO2分子跑出来，结构被破坏了。请问该如何调整？查了很多数据库没找到这个分子。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-4-18 15:38
Cu必须做显式溶剂化
这个体系的基态不可能是闭壳层单重态，只可能是开壳层单重态或三重态，如果是前者需要准备片段初猜，如果是后者需要改自旋多重度
先把这两个问题解决了，再谈别的

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-18 15:46
带上两个柠檬酸根让Cu配位饱和，Google图片搜索很容易就能找到图

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用6-31+G*远不如用6-311G*

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2023-4-19 15:10

wzkchem5 发表于 2023-4-18 15:38
Cu必须做显式溶剂化
这个体系的基态不可能是闭壳层单重态，只可能是开壳层单重态或三重态，如果是前者需要 ...

老师您好！您跟sob老师的意思好像是这2个铜配位不饱和，我想问一下这个是为什么，怎么看出来不饱和的?

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-4-19 20:00

yaoyuan0711 发表于 2023-4-19 08:10
老师您好！您跟sob老师的意思好像是这2个铜配位不饱和，我想问一下这个是为什么，怎么看出来不饱和的?

查一下Cu一般的配位数在什么范围，再数数你的Cu的配位数，就知道了

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2023-4-23 14:56

wzkchem5 发表于 2023-4-19 20:00
查一下Cu一般的配位数在什么范围，再数数你的Cu的配位数，就知道了

感谢您的指导！我之前结构有误，应该是1个铜离子，然后自旋多重度改成2就优化成功了。
随后因为铜配位不饱和，在铜离子周围加了2个水分子（溶剂为水），优化了几步，SCF不收敛了

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-4-23 15:08

yaoyuan0711 发表于 2023-4-23 07:56
感谢您的指导！我之前结构有误，应该是1个铜离子，然后自旋多重度改成2就优化成功了。
随后因为铜配位不 ...

SCF没有不收敛啊

作者
Author: yaoyuan0711 时间: 2023-4-23 15:58

wzkchem5 发表于 2023-4-23 15:08
SCF没有不收敛啊

我上传的文件是没加水分子的，加了水分子的重新提交任务又正常了

还有一个问题请教您，我还算了MIL101(Fe)的MOF分子，其中3个Fe分别是+3价，配位6个对苯二甲酸、2个水分子、1个Cl离子。然后Fe3+的最外层电子是3d5，O2-是弱场配体，如果3个Fe是自旋耦合，自旋多重度是6？如果是反铁磁耦合，自旋多重度是16？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-4-23 16:19

yaoyuan0711 发表于 2023-4-23 08:58
我上传的文件是没加水分子的，加了水分子的重新提交任务又正常了

还有一个问题请教您，我还算了MIL101 ...

反铁磁耦合是6，铁磁耦合是16
“自旋耦合”既包括铁磁耦合也包括反铁磁耦合
把铁磁耦合和反铁磁耦合的定义搞清楚

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