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标题: CP2K中有关于截断半径的参数设置吗? [打印本页]

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captain    时间: 2023-4-19 21:42
标题: CP2K中有关于截断半径的参数设置吗?
本帖最后由 captain 于 2023-4-19 21:51 编辑

一般使用cutoff做周期性体系MD模拟时,盒子最短的边长必须大于cutoff的二倍。
对于CP2K,只找到了关于CUTOFF(截断能)、REL CUTOFF(参考截断能)以及CUTOFF RADlUS(库仑截断半径)的设定。
请问大神,CP2K动力学设定中有关于截断半径的参数设置吗?也就是怎么知道盒子的边长已经大于cutoff的二倍?
另外,对于生物大分子,是否还应确保分子与边界距离大于cutoff的一半?
十分感谢!



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k64_cc    时间: 2023-4-20 00:49
MM计算时是有的,具体你再看看手册;QM部分不应当有截断半径,它不是pairwise interaction。
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sobereva    时间: 2023-4-20 05:04
跟DFT计算有关的截断半径是杂化泛函计算用的库仑截断,以及DFT-D色散校正考虑的距离上限。前者需要小于晶胞最短边长的一半,后者没这个要求。
对于MM计算,更不用说了,显然有。

盒子边长是你自己知道的。如果是控压的动力学,需要自己监控盒子尺寸的变化。


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captain    时间: 2023-4-20 07:25
k64_cc 发表于 2023-4-20 00:49
MM计算时是有的,具体你再看看手册;QM部分不应当有截断半径,它不是pairwise interaction。

好的,谢谢指导!
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captain    时间: 2023-4-20 07:26
sobereva 发表于 2023-4-20 05:04
跟DFT计算有关的截断半径是杂化泛函计算用的库仑截断,以及DFT-D色散校正考虑的距离上限。前者需要小于晶胞 ...

明白了,谢大神指导!




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