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标题: 关于如何计算解离能 [打印本页]

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奈落丢丢    时间: 2016-7-4 09:18
标题: 关于如何计算解离能
计算新手学习请教,需要计算几个黄酮类化合物的解离能,哪位老师能够给我详细讲解一下如何计算等等吗,灰常感谢,在线等待~~

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sobereva    时间: 2016-7-4 15:34
具体要解离什么?
如果是解离某个键,叫键解离能,整体能量减断键后两个片段能量就完了。记得整体和片段都要分别优化。
作者
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奈落丢丢    时间: 2016-7-4 15:54
谢谢sob老师的回复,是黄酮化合物酚羟基上O-H之间的断裂
按照您说的,就是分子能量减去解离产生的自由基能量和H原子的能量吗
作者
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sobereva    时间: 2016-7-5 03:47
奈落丢丢 发表于 2016-7-4 15:54
谢谢sob老师的回复,是黄酮化合物酚羟基上O-H之间的断裂
按照您说的,就是分子能量减去解离产生的自由基能 ...


作者
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奈落丢丢    时间: 2016-7-5 09:10
谢谢您
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木小虫427    时间: 2019-11-19 17:01
本帖最后由 木小虫427 于 2019-11-19 17:54 编辑

请问您是用的Gaussian还是MS?是需要构造一个包含几百个分子的模块算平均吗?需要考虑环境影响吗(比如固体溶于水之后解离,用考虑在模型中加入溶剂吗)?之前没有接触过解离能,想大概了解一下这个计算量大不大,需要时间长不长~希望您有时间可以指点一二,非常感谢!
作者
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sobereva    时间: 2019-11-20 02:20
木小虫427 发表于 2019-11-19 17:01
请问您是用的Gaussian还是MS?是需要构造一个包含几百个分子的模块算平均吗?需要考虑环境影响吗(比如固体 ...

M$里几乎只有Dmol3能算这类,但绝对不要用:
为什么我非常不建议购买和使用D摩3量子化学程序
http://sobereva.com/508

只需要用单个分子,恰当考虑质子化态,用溶剂模型就完了

作者
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木小虫427    时间: 2019-11-20 11:40
sobereva 发表于 2019-11-20 02:20
M$里几乎只有Dmol3能算这类,但绝对不要用:
为什么我非常不建议购买和使用D摩3量子化学程序
http://so ...

嗯嗯,谢谢您的指点!~
作者
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陈小北    时间: 2019-11-28 11:18
sobereva 发表于 2016-7-4 15:34
具体要解离什么?
如果是解离某个键,叫键解离能,整体能量减断键后两个片段能量就完了。记得整体和片段都 ...

Sob老师好

我想问一下如果我想算环己烯的C=C双键解离能具体应该怎么操作,断键之后分子并不成两个片段,是应该在GaussView里面直接选中两个C然后取消键吗,还是应该怎么样呢?

谢谢您,祝您生活愉快
作者
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sobereva    时间: 2019-11-29 08:34
陈小北 发表于 2019-11-28 11:18
Sob老师好

我想问一下如果我想算环己烯的C=C双键解离能具体应该怎么操作,断键之后分子并不成两个片段 ...

用Gaussian分别计算每个片段

量化计算结果和键连关系根本毫无关系
作者
Author:
陈小北    时间: 2019-11-30 19:12
sobereva 发表于 2019-11-29 08:34
用Gaussian分别计算每个片段

量化计算结果和键连关系根本毫无关系

是这样的老师

(, 下载次数 Times of downloads: 100)

这是我的体系,它是一个环,我想计算图中双键的键解离能,这个双键断裂之后就是一个片段,我想问一下这种情况下怎么计算
谢谢老师
作者
Author:
sobereva    时间: 2019-12-2 02:08
陈小北 发表于 2019-11-30 19:12
是这样的老师

最简单的做法是通过Multiwfn计算Laplacian键级直接估计,看下文“键级分析”那一节的拉普拉斯键级的介绍
Multiwfn支持的分析化学键的方法一览
http://sobereva.com/471http://bbs.keinsci.com/thread-12488-1-1.html

另外的做法就是把对面的单键旋转180度使得双键破坏,然后用对称破缺单重态方式做个(限制性)优化再算个能量,与原先的求差。但这种做法不免掺进去其它因素。对称破缺单重态的计算参考
谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态
http://sobereva.com/82

作者
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naoki    时间: 2022-6-27 11:02
sobereva 发表于 2016-7-5 03:47

sob老师好,我想咨询一下您解离后的片段应该表示为自由基还是离子?是否是想要考察均裂则用自由基计算,考察异裂则用离子计算?非常感谢!
作者
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wzkchem5    时间: 2022-6-27 15:21
naoki 发表于 2022-6-27 04:02
sob老师好,我想咨询一下您解离后的片段应该表示为自由基还是离子?是否是想要考察均裂则用自由基计算, ...

是的
作者
Author:
naoki    时间: 2022-6-27 16:44
wzkchem5 发表于 2022-6-27 15:21
是的

好的,谢谢王老师
作者
Author:
yjb    时间: 2023-1-6 17:09
sobereva 发表于 2016-7-4 15:34
具体要解离什么?
如果是解离某个键,叫键解离能,整体能量减断键后两个片段能量就完了。记得整体和片段都 ...

老师,把一个整体变成两个片段后,整体的结构本来的自旋是1。片段变成了两个自由基,自旋发生了改变,这样计算是否正确。
作者
Author:
sobereva    时间: 2023-1-7 02:05
yjb 发表于 2023-1-6 17:09
老师,把一个整体变成两个片段后,整体的结构本来的自旋是1。片段变成了两个自由基,自旋发生了改变,这 ...

那叫自旋多重度,不要省略

我不知道你想算什么,如果把两个解离后的片段作为一个整体来计算,需要按自旋极化单重态来计算,看下文
谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态
http://sobereva.com/82

如果每个片段单独计算,自旋多重度是2




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