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标题: 请教使用OPLS力场缺少Al原子参数 [打印本页]

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xuming    时间: 2023-4-21 19:22
标题: 请教使用OPLS力场缺少Al原子参数
最近想模拟关于Al/PEG的聚合物电解质,建立力场文件时缺少Al-O的参数,请问这种情况如何处理,如果换力场的话,这种体系应该适合那种电场?


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牧生    时间: 2023-4-21 21:56
amber+gaff是最佳的选择。用sobtop来生成top文件,再也不能更傻瓜化了。
http://sobereva.com/soft/Sobtop/

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xuming    时间: 2023-4-24 15:39
牧生 发表于 2023-4-21 21:56
amber+gaff是最佳的选择。用sobtop来生成top文件,再也不能更傻瓜化了。
http://sobereva.com/soft/Sobtop ...

您好,想再请问您一下使用sobtop后指认gaff时没有Al原子类型,然后自动指认了UFF原子类型,请问这样可以吗?
另外在指认计算MMFF94原子电荷时失败,想请教一下如何解决





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