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标题: 关于水的明尼苏达描述符求教 [打印本页]

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Author: 社会主义小战士 时间: 2023-4-21 21:07
标题: 关于水的明尼苏达描述符求教
各位前辈好！因为想用Gaussian搞一个H2O和DMF混合溶剂的隐式溶剂，来给纳米粒子做结构优化，
去查了明尼苏达溶剂描述符数据库，欣喜的发现H2O和DMF都有，但是H2O的部分参数不全，我想这可能是根据参数的定义，比如既不能说水是酸也不能说它是碱，所以这里的酸碱度就不太好表示。
那么这里是否可以认为是0呢？或者说用0这个值是否有问题？对于表面张力，我换算出来大概在100，能否放进去用呢？
最后是想根据DMF和H2O的体积比来做加权，得到混合溶剂的SMD参数。
所以现在很困扰，能不能这样搞一下？？？
还请各位前辈不吝赐教啊！

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-4-21 22:56
可以考虑用PCM来做结构优化（此时可以定义水/DMF混合溶剂），并且挑一个结构做纯水、纯DMF的SMD单点计算，和同样结构下纯水、纯DMF计算的PCM单点结果对比，证明对于纯水和纯DMF而言PCM和SMD的结果都是足够接近的，因此水/DMF混合溶剂的PCM结果也理应和SMD结果接近，从而绕开SMD不好定义水和非水溶剂的混合溶剂的问题

作者
Author: 社会主义小战士 时间: 2023-4-22 02:01

wzkchem5 发表于 2023-4-21 22:56
可以考虑用PCM来做结构优化（此时可以定义水/DMF混合溶剂），并且挑一个结构做纯水、纯DMF的SMD单点计算， ...

万分感谢前辈！

作者
Author: 社会主义小战士 时间: 2023-4-22 02:06

wzkchem5 发表于 2023-4-21 22:56
可以考虑用PCM来做结构优化（此时可以定义水/DMF混合溶剂），并且挑一个结构做纯水、纯DMF的SMD单点计算， ...

前辈您好，我还想问一下，这里考虑用PCM在自定义混合溶剂下做OPT计算的话，我在Gaussian输入文件末尾，结构坐标后面空了一行输入

eps=XXX
epsinf=XXX

Dis
Rep
Cav

这样是合适的么？

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