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标题: 求助：ORCA任务中断和计算时长问题 [打印本页]

作者
Author: Tracy民工 时间: 2023-4-23 21:42
标题: 求助：ORCA任务中断和计算时长问题
各位老师好，我的体系是有机金属配位笼，含有Zn，Na金属原子和C，N，O，H原子。简化掉一些侧链后262个原子。
inp文件设置为：
! B97-3c noautostart miniprint nopop
%maxcore  3000
%pal nprocs 40 end

遇到的问题是：
1.我的电脑和服务器通过Mobaxterm，SSH连接，中间电脑和服务器网络断了一次后，计算就终止了，我查看的时候，文件夹一堆tmp文件，计算也不在队列中出现，请问如何提交到后台计算使网络问题不影响计算？网上查可以用screen，但我输入screen并没出现提示。
2.当时已经计算了四个小时了，请问有没有老师有经验：只是计算单点能需要这么久吗？是不是我的设置和结构可能有问题呢？

计算中止时的out文件如下：
--------------------------------------------------------------------------------------------
Iter.       energy          ||Error||_2       Shift    TRadius  Mac/Mic       Rej.
--------------------------------------------------------------------------------------------
WARNING: 1625905 diagonal Hessian elements are negative!
0    -7419.647390236307    3.339369e+02                   0.400 (TRAH MAcro) No
WARNING : negative HOMO - LUMO gap : -103.146261
0    dE -1.330853e+02    2.037110e+01 -8.2873e+02    0.400 (TRAH MIcro)
0    dE -1.332705e+02    1.101085e+01 -8.3230e+02    0.400 (TRAH MIcro)
0    dE -1.332890e+02    9.346536e+00 -8.3263e+02    0.400 (TRAH MIcro)
0    dE -1.332890e+02    9.314688e+00 -8.3264e+02    0.400 (TRAH MIcro)
0    dE -1.332943e+02    8.732959e+00 -8.3272e+02    0.400 (TRAH MIcro)
0    dE -1.333332e+02    2.037709e+00 -8.3340e+02    0.400 (TRAH MIcro)
0    dE -1.333361e+02    3.489929e-01 -8.3345e+02    0.400 (TRAH MIcro)
0    dE -1.333363e+02    1.510261e-01 -8.3345e+02    0.400 (TRAH MIcro)
0    dE -1.333363e+02    3.282165e-02 -8.3345e+02    0.400 (TRAH MIcro)
0    dE -1.333363e+02    2.389744e-02 -8.3345e+02    0.400 (TRAH MIcro)
0    dE -1.333363e+02    2.375179e-02 -8.3345e+02    0.400 (TRAH MIcro)
0    dE -1.333363e+02    2.351101e-02 -8.3345e+02    0.400 (TRAH MIcro)
0    dE -1.333363e+02    1.885695e-02 -8.3345e+02    0.400 (TRAH MIcro)
0    dE -1.333363e+02    6.211796e-03 -8.3345e+02    0.400 (TRAH MIcro)
WARNING: 1623832 diagonal Hessian elements are negative!

中间一直迭代......最后是
WARNING: 23 diagonal Hessian elements are negative!
70    -22737.875845949347    7.503080e-01             139555.583 (TRAH MAcro) No
WARNING : negative HOMO - LUMO gap : -0.113124
70    dE -3.172462e-01    1.467573e+00 -4.6075e-01    0.614 (TRAH MIcro)
70    dE -4.232912e-01    6.405844e-01 -5.4240e-01    0.749 (TRAH MIcro)
70    dE -5.205908e-01    4.812772e-01 -5.8700e-01    0.880 (TRAH MIcro)
70    dE -6.171706e-01    5.236582e-01 -6.1066e-01    1.011 (TRAH MIcro)
70    dE -7.356634e-01    1.627339e-01 -6.2757e-01    1.160 (TRAH MIcro)
70    dE -7.487750e-01    6.023318e-02 -6.2900e-01    1.175 (TRAH MIcro)
70    dE -7.517494e-01    3.247984e-02 -6.2930e-01    1.179 (TRAH MIcro)
70    dE -7.527429e-01    1.793441e-02 -6.2938e-01    1.180 (TRAH MIcro)
70    dE -7.530323e-01    8.499300e-03 -6.2940e-01    1.180 (TRAH MIcro)
71    -22738.419527018646    4.443957e-01             139555.583 (TRAH MAcro) No
71    dE -2.230642e-02    8.764752e-01 -4.4176e-02    0.099 (TRAH MIcro)
71    dE -9.827505e-02    4.884648e-01 -1.6172e-01    0.464 (TRAH MIcro)
71    dE -1.032943e-01    1.635526e-01 -1.6805e-01    0.479 (TRAH MIcro)
71    dE -1.037052e-01    3.794361e-02 -1.6883e-01    0.478 (TRAH MIcro)
71    dE -1.037010e-01    1.266638e-02 -1.6891e-01    0.477 (TRAH MIcro)
71    dE -1.036798e-01    5.059485e-03 -1.6892e-01    0.477 (TRAH MIcro)
72    -22738.520879884709    8.710721e-02             167466.699 (TRAH MAcro) No
72    dE -8.909303e-04    3.038425e-01 -1.7811e-03    0.020 (TRAH MIcro)
72    dE -4.479172e-03    1.895541e-01 -8.8220e-03    0.124 (TRAH MIcro)
72    dE -4.699475e-03    7.000359e-02 -9.2427e-03    0.130 (TRAH MIcro)
72    dE -4.726319e-03    1.699897e-02 -9.2947e-03    0.130 (TRAH MIcro)

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-4-23 22:38
（1）提交的时候用nohup
（2）SCF能量出现极其大幅度的降低，怀疑是有基组线性相关问题，可以增加%scf里的sthresh，具体做法以及推荐值自己在orca手册里搜sthresh就知道

作者
Author: Tracy民工 时间: 2023-4-24 11:29

wzkchem5 发表于 2023-4-23 22:38
（1）提交的时候用nohup
（2）SCF能量出现极其大幅度的降低，怀疑是有基组线性相关问题，可以增加%scf里的 ...

谢谢您，学习到了~

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