计算化学公社
标题:
高斯计算遇到过渡态的难以消除的甲基单键旋转的虚频
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作者Author:
syx123456
时间:
2023-4-23 22:48
标题:
高斯计算遇到过渡态的难以消除的甲基单键旋转的虚频
各位老师好,我在高斯计算过渡态时,遇到了一个难以消除的虚频。计算使用了ωB97XD/6-31G(d)基组,无其他关键词和IOp输入,使用Gaussian 16 A.03版本,结构优化为为opt(TS)+freq,未使用溶剂模型。
从附件中输出文件中可以看到,这是一个氢转移过程,除了过渡态对应的虚频外,还有不想要的甲基单键旋转的虚频。输出文件在附件的压缩包中。
我尝试了将甲基旋转一定角度后,先进行固定优化(此时冻结过渡态中感兴趣的键),再进行opt(TS,calcfc,noeigen)+freq。虚频大小和振动模式不变。
使用GaussView的Manual Displacement功能将不感兴趣的虚频拉动至最大偏移后,重新进行关键词不变的结构优化,均无效。
使用gentor对该甲基进行单键旋转,然后在相同计算级别下对结构进行单点能计算,结果表明该甲基在此振动模式下处于能量极小点。这一步的目的是进行刚性扫描。
由于高斯不支持笛卡尔坐标下进行刚性扫描,因此数据使用python脚本读取SCF能量后,用matplotlib进行画图。
请问我应该如何消除该虚频,或应该对这种表面上看起来的假虚频进行什么解释?
作者Author:
sobereva
时间:
2023-4-24 03:22
加上int=superfine。如果还不行,opt加上tight,如果还不行,加上recalc=3。maxstep=1这么小根本没必要
固定优化 毫无意义
作者Author:
syx123456
时间:
2023-4-24 12:22
好的,谢谢老师!
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