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标题: 请教各位老师通用的分子朝向定义 [打印本页]

作者
Author: Markmahao 时间: 2023-4-24 16:24
标题: 请教各位老师通用的分子朝向定义
各位老师好，如题，想做分子空间描述的统一。请问有没有类似Gaussian中标准朝向的定义（但这种标准朝向有可能是对映体，不唯一）。是否有算法可以以同一个法则来定义分子的空间坐标和朝向？非常感谢。

作者
Author: zjxitcc 时间: 2023-4-24 16:45
惯量主轴三个单位向量要满足右手螺旋定则，因此分子旋转到主轴坐标系后必然还是一样的手性，不会是对映体。如果自己编程产生了对映体，说明代码写错了（我当年犯过这个错误，没保证三个单位向量满足右手螺旋定则）。不过，即使满足了右手螺旋定则，我个人的理解是主轴朝向仍然有4种，因为x,y,z可以取相反的符号，凡是满足右手螺旋定则的即可。永远唯一朝向是个伪命题，因为对高对称性分子（例如I_h点群），朝哪里都可以。

作者
Author: Markmahao 时间: 2023-4-25 21:33

zjxitcc 发表于 2023-4-24 16:45
惯量主轴三个单位向量要满足右手螺旋定则，因此分子旋转到主轴坐标系后必然还是一样的手性，不会是对映体。 ...

谢谢老师指点，好像明白了，我再试试。

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