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标题: 求助：用gmx_mpi traj怎么计算体系中每个CL离子的Z轴坐标变化？ [打印本页]

作者
Author: 灵芝5 时间: 2023-4-25 21:57
标题: 求助：用gmx_mpi traj怎么计算体系中每个CL离子的Z轴坐标变化？
各位老师！

我模拟了一个膜蛋白，体系中有241个CL离子和211个钠离子，想用gmx_mpi traj指令计算每个钠、氯离子的z轴位置随时间的变化？

请问加什么选项可以计算每个钠、氯离子的z轴位置随时间的变化？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-26 06:57
用VMD脚本，极其简单

(, 下载次数 Times of downloads: 6)

作者
Author: 灵芝5 时间: 2023-8-3 16:19
谢谢卢老师解答！

作者
Author: LNN 时间: 2024-1-23 19:15
不好意思打扰您，目前我也要计算离子Z轴位置随时间变化，想得到图像，请教您这个问题。
我也尝试过TCL脚本，但是没办法做到输出图像，请问您解决了吗？非常感谢您的解答！

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