计算化学公社

标题: 使用multiwfn未能从pdb文件生成wfn文件 [打印本页]

作者
Author: ConjugaLove3 时间: 2023-4-26 15:28
标题: 使用multiwfn未能从pdb文件生成wfn文件
本人新手，希望能得到各位帮助。根据http://sobereva.com/484中生成wfn文件的步骤，我使用了pdb数据库下载的4cnh.pdb，并成功生成了N.gjf , N-1.gjf , N+1.gjf , N.out , N-1.out , N+1.out , 但在按“y”生成wfn文件中出现错误，看到一讨论帖中使用Gaussian可以生成，苦于刚接触不会Gaussian，用Gaussian打开N.gjf后无法在坐标下面空一行地方输入D:，直接输出的话会弹出图示的错误信息，想求助一下应当如何解决，谢谢各位。

作者
Author: 牧生 时间: 2023-4-26 15:56
Multiwfn本身不生生成wfn。需要调用已经安装好的Gaussian或者orca来计算得到wfn文件。

作者
Author: ConjugaLove3 时间: 2023-4-26 22:09

牧生发表于 2023-4-26 15:56
Multiwfn本身不生生成wfn。需要调用已经安装好的Gaussian或者orca来计算得到wfn文件。

好的谢谢，那Gaussian部分出现的问题是应该怎么解决呢

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-27 00:04
检查out文件内容判断失败的原因，自己看不懂就上传

自己用文本编辑器编辑gjf文件。用Gaussian图形界面来编辑完全多此一举

作者
Author: ConjugaLove3 时间: 2023-4-27 13:06
(, 下载次数 Times of downloads: 18) (, 下载次数 Times of downloads: 17) (, 下载次数 Times of downloads: 14) 本来是想将out文件上传上来的，但显示文件类型限制无法上传那么大的文件

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-27 13:27

ConjugaLove3 发表于 2023-4-27 13:06
本来是想将out文件上传上来的，但显示文件类型限制无法上传那么大的文件

如置顶的新社员必读贴和论坛的版头所示，上传超过500KB的文本型文件上传前必须先压缩再上传，以节约论坛空间、节约下载耗时。

提示写明了，给的内存不够。修改配置文件让默认内存使用量上限足够大，看下文
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439（http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html）

要么自己给gjf文件加上%mem设置然后自己调用Gaussian算gjf文件

你的体系有近5000个原子，根本别指望DFT能算，明显是在胡算瞎算

作者
Author: ConjugaLove3 时间: 2023-4-27 17:18

sobereva 发表于 2023-4-27 13:27
如置顶的新社员必读贴和论坛的版头所示，上传超过500KB的文本型文件上传前必须先压缩再上传，以节约论坛 ...

好的好的，谢谢

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)