计算化学公社

标题: Linux系统安装Gaussian软件时的.bashrc文件命令写入问题 [打印本页]

作者
Author: S.C.zx 时间: 2023-4-26 23:17
标题: Linux系统安装Gaussian软件时的.bashrc文件命令写入问题
各位老师，同学
本人最近参考sob老师的博文http://sobereva.com/444，购入一台双路 EPYC 7R32 96核服务器，进行Gaussian软件安装，安装步骤遵循http://sobereva.com/439博文内容（应用该方法，本人在北鲲云等超算平台进行软件安装并计算，该安装方法确实简便）。在.bashrc文件中添加环境变量等命令行后，运行chmod 750 -R *命令安装完成。输入计算命令进行尝试，显示g16：未找到命令，我已反复尝试了一天仍未解决问题，图片中是我在.bashrc文件中添加的命令行，请各位朋友帮忙看看问题出在什么地方了，不胜感激。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-26 23:24
确保改完后重新进入了shell，否则.bashrc里新添加的内容不生效

如果已经这么做了，手动运行添加到.bashrc里的那些命令看有什么提示、运行后能否用g16命令

PS：以后手机拍照的图，应恰当剪切并且保存到合适文件大小后再上传，以免浪费服务器空间。

作者
Author: Oxygen 时间: 2023-4-27 10:59
source ~/.bashrc

作者
Author: S.C.zx 时间: 2023-4-27 23:01
谢谢你，我使用了source ~/.bashrc立刻加载修改后的设置，确实有效。

作者
Author: S.C.zx 时间: 2023-4-27 23:18

sobereva 发表于 2023-4-26 23:24
确保改完后重新进入了shell，否则.bashrc里新添加的内容不生效

如果已经这么做了，手动运行添加到.bashr ...

你好，sob老师，我的问题已解决，按照博文http://sobereva.com/439上的方法完全没问题。我昨天遇到的困难可能是修改完成后未重新进入shell，.bashrc里新添加的内容未生效，我今天修改完.bashrc文件后，使用了source ~/.bashrc命令。另外，我把Gaussian移动了文件夹，重新进行了环境变量配置，也许昨天写的路径也不对。总之，谢谢您的回复。
另外，安装后遇到提示Error: illegal instruction , illegal opcode，并按照您博文中的方法，在运行Gaussian前通过命令定义环境变量：export PGI_FASTMATH_CPU=sandybridge解决，每次计算任务提交前都需要定义环境变量，还是只定义一次？

作者
Author: S.C.zx 时间: 2023-4-27 23:19

Oxygen 发表于 2023-4-27 10:59
source ~/.bashrc

谢谢你，我使用了source ~/.bashrc立刻加载修改后的设置，确实有效。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-28 11:54

S.C.zx 发表于 2023-4-27 23:18
你好，sob老师，我的问题已解决，按照博文http://sobereva.com/439上的方法完全没问题。我昨天遇到 ...

写到.bashrc里不就完了

作者
Author: sobereva 时间: 2023-4-28 11:55
强烈不建议用source ~/.bashrc代替重新进入shell，因为这种做法可能会导致有的变量被累加定义，不“干净”和“优雅”

作者
Author: S.C.zx 时间: 2023-4-28 16:24

sobereva 发表于 2023-4-28 11:55
强烈不建议用source ~/.bashrc代替重新进入shell，因为这种做法可能会导致有的变量被累加定义，不“干净” ...

谢谢sob老师，受教了。

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