计算化学公社

标题: cp2k跑结构优化时老是中途停止，续算后又能继续跑，但可能又中途停止在类似的位置 [打印本页]

作者
Author: 预想 时间: 2023-5-3 16:36
标题: cp2k跑结构优化时老是中途停止，续算后又能继续跑，但可能又中途停止在类似的位置
直接用的是老师课程里的一个输入文file\opt\black_P\basis_set\DZVP-MOLOPT-GTH\DZVP-MOLOPT-GTH.inp第一次停在 (, 下载次数 Times of downloads: 20)
然后直接拿.restart 在新的文件夹中续算，计算接上了，但是停到了第九次同样的位置

(, 下载次数 Times of downloads: 22)
想请教老师大概是什么原因

我拿自己的体系也有这种一样的情况，续算就正常了，有时候也能一直正常

作者
Author: sobereva 时间: 2023-5-3 17:17
如果你是指程序自动退出，而不是卡住，说明装得有问题
如果是卡住，用ssmp版或不同核数并行再试

作者
Author: 预想 时间: 2023-5-3 17:45

sobereva 发表于 2023-5-3 17:17
如果你是指程序自动退出，而不是卡住，说明装得有问题
如果是卡住，用ssmp版或不同核数并行再试

谢谢老师的回复，就是我查看作业的状态，显示在run，但是输出文件并不更新，停在哪里。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-5-3 18:01

预想发表于 2023-5-3 17:45
谢谢老师的回复，就是我查看作业的状态，显示在run，但是输出文件并不更新，停在哪里。

就是我说的后一种情况

作者
Author: 预想 时间: 2023-5-3 18:03

sobereva 发表于 2023-5-3 18:01
就是我说的后一种情况

好嘞，谢谢老师的回复~

作者
Author: Geocmpt 时间: 2023-11-27 17:41
您好，我也遇到同样问题，卡在 extrapolation method.........那里。换成ssmp可以跑，但速度比popt慢很多。你找到更好的解决方式嘛。

作者
Author: chemistryMaga 时间: 2023-12-4 15:22
遇到了相同的问题，这是CP2K自身的bug吗

作者
Author: 预想 时间: 2023-12-4 15:53

chemistryMaga 发表于 2023-12-4 15:22
遇到了相同的问题，这是CP2K自身的bug吗

我觉得是的。。。换成ssmp不会卡，但速度慢了好几倍

作者
Author: 预想 时间: 2023-12-4 15:56

Geocmpt 发表于 2023-11-27 17:41
您好，我也遇到同样问题，卡在 extrapolation method.........那里。换成ssmp可以跑，但速度比popt慢很多。 ...

不用2023的两个版本，用2022版本卡的情况好点，建议用2022试试。2022不行我的解决办法也只有换成ssmp版本。。

作者
Author: chemistryMaga 时间: 2023-12-5 10:23

预想发表于 2023-12-4 15:56
不用2023的两个版本，用2022版本卡的情况好点，建议用2022试试。2022不行我的解决办法也只有换成ssmp版本 ...

我用的就是2023版本的，现在是停了就杀掉用.restart续跑

作者
Author: ZHUOHAO 时间: 2023-12-6 13:57

chemistryMaga 发表于 2023-12-5 10:23
我用的就是2023版本的，现在是停了就杀掉用.restart续跑

请问下，cp2k续算要在脚本文件里怎么设置读取之前的波函数啊。谢谢

作者
Author: wolfli369 时间: 2023-12-6 14:14
本帖最后由 wolfli369 于 2023-12-6 14:16 编辑

Geocmpt 发表于 2023-11-27 17:41
您好，我也遇到同样问题，卡在 extrapolation method.........那里。换成ssmp可以跑，但速度比popt慢很多。 ...

使用最新版Multiwfn重新生成相应的输入文件，重新跑一下

作者
Author: Geocmpt 时间: 2023-12-7 19:19

wolfli369 发表于 2023-12-6 14:14
使用最新版Multiwfn重新生成相应的输入文件，重新跑一下

最新版本的Multiwfn生成CP2K输入文件有区别嘛？我对比下没发现哪里有区别呢？

作者
Author: 汪杰 时间: 2024-11-28 16:01

chemistryMaga 发表于 2023-12-5 10:23
我用的就是2023版本的，现在是停了就杀掉用.restart续跑

它这个没有单纯的.restart文件啊，只有一个restart.wfn文件，是不是要删掉后面的.wfn呢？

作者
Author: xjtuglr 时间: 2024-11-29 14:00
我也遇到过类似的情况，在超算上跑的，开了OT，可能是由于晶胞边长设置的不恰当导致了程序卡住，我扩胞以后设置多节点并行可以正常运行，你这情况有可能可以通过调节K点数量或者扩胞尝试一下

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