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标题: 求助:请问如何MD模拟得到分子偶极矩自相关函数,从而求得IR光谱 [打印本页]

作者
Author:
wildon    时间: 2023-5-3 22:02
标题: 求助:请问如何MD模拟得到分子偶极矩自相关函数,从而求得IR光谱
请问如何通过lammps的模拟得到分子偶极矩变化,并计算自相关函数的傅里叶变化,从而得到红外光谱?
目前了解可以通过量化程序或基于第一性原理的程序进行IR的计算,但我想通过lammps进行MD的模拟求得IR分布。

思路为:
1. 通过lammps中的 compute  dipole 计算整体或某个方向上的偶极矩变化;
2. 求第一步偶极矩变化的自相关函数分布,并进行傅里叶变化,这样能得到IR分布嘛?
PS:第2步是不是要进行展宽的处理?

看了一晚上的红外光谱计算,基于MD计算红外光谱资料比较少,了解的不够深入,请有相关的老师不吝赐教,谢谢!





作者
Author:
wildon    时间: 2023-5-3 22:04
目前的进展为:通过lammps中的 compute  dipole 计算了电场方向的偶极矩变化,通过python代码计算了偶极矩随时间变化的自相关函数。
后续应该如何做呢。
再对自相关函数分布进行傅里叶变化吗?

作者
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sobereva    时间: 2023-5-4 05:35
直接就有现成的程序

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作者
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wildon    时间: 2023-5-4 09:09
sobereva 发表于 2023-5-4 05:35
直接就有现成的程序

谢谢老师




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