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标题: newton-x 2.2 激发态动力学轨迹分析时内坐标文件如何提供? [打印本页]

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hunterpyj    时间: 2023-5-7 10:32
标题: newton-x 2.2 激发态动力学轨迹分析时内坐标文件如何提供?
请问: 用Newton-x 2.2 做激发态动力学轨迹分析时能量、波函数随时间变化都可以正常得到,但做坐标(如某一键长)随时间变化分析时文件 prop.3中无数据,提示需要提供内坐标文件intfcl,这个不知如何提供,格式是啥样的。 在runnx.error中提示出错信息如下,不知有人遇到过类似问题没有,请教解决办法,
[root@localhost DEBUG]# more runnx.error
Cannot open ../TRAJ1/RESULTS/intec. at /home/hunter/nx/NX-2.2-B09/bin/collect.pl line 191.
Cannot open ../TRAJ2/RESULTS/intec. at /home/hunter/nx/NX-2.2-B09/bin/collect.pl line 191.


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融雨青    时间: 2023-5-7 18:52
我之前遇到过类似的问题,这个intfcl文件应该是Newton-X生成的中间文件,出现这个错误可能是Newton-X有问题。 (, 下载次数 Times of downloads: 8)

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hunterpyj    时间: 2023-5-8 15:04
融雨青 发表于 2023-5-7 18:52
我之前遇到过类似的问题,这个intfcl文件应该是Newton-X生成的中间文件,出现这个错误可能是Newton-X有问题 ...

请教之后问题怎么解决的,我换成2.4 版本还是一样的问题:

Would you like to generate internal coordinate file?  (default=y) y

Can't locate Chemistry/InternalCoords/Builder.pm in @INC (@INC contains: /home/hunter/nx/NX-2.4-B06/bin/lib /usr/local/lib64/perl5 /usr/local/share/perl5 /usr/lib64/perl5/vendor_perl /usr/share/perl5/vendor_perl /usr/lib64/perl5 /usr/share/perl5 .) at /home/hunter/nx/NX-2.4-B06/bin/xyz2zmat.pl line 7.
BEGIN failed--compilation aborted at /home/hunter/nx/NX-2.4-B06/bin/xyz2zmat.pl line 7.
:( geom.zmat at /home/hunter/nx/NX-2.4-B06/bin/zmat2intc.pl line 83.
cp: 无法获取"intcfl" 的文件状态(stat): 没有那个文件或目录

提示还是需要提供intfcl 文件
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融雨青    时间: 2023-5-8 18:53
这个问题我也没解决




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