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标题: NEB计算总是能量跳变 [打印本页]

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ikea1984    时间: 2023-5-11 20:02
标题: NEB计算总是能量跳变
用VTST和VASP编译,然后做CI-NEB。发现某些image总是能量隔若干步就会突然升高2、3eV,检查结构发现此时有个别键长出现跳变,从而导致整个NEB过程不能收敛。这种问题应该怎么处理呢?如果用dimer,有些计算可以找到一个过渡态,但是怎么判断这个过渡态是不是想要的过程仍然有点困难。

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Deepast    时间: 2023-5-12 00:26
跳变大的话估计是你插点原子顺序不对
找到过渡态的话,算个频率验证就行
根据我的经验,稍微复杂一点的化学反应neb收敛都很慢,甚至不收敛
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ikea1984    时间: 2023-5-12 05:54
Deepast 发表于 2023-5-12 00:26
跳变大的话估计是你插点原子顺序不对
找到过渡态的话,算个频率验证就行
根据我的经验,稍微复杂一点的化 ...

嗯,您说的有道理。但是我这个反应是一个有机反应,不是那种简单的扩散或者单个键断裂,感觉原子在空间中存在一定的重排,这种很难认定原子顺序一定是怎么样。能否把同类原子按可能顺序都排列一下,然后选择ini和final的dist最小的映射关系?
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Deepast    时间: 2023-5-12 08:41
ikea1984 发表于 2023-5-12 05:54
嗯,您说的有道理。但是我这个反应是一个有机反应,不是那种简单的扩散或者单个键断裂,感觉原子在空间中 ...

距离最短不一定是你想要的,而且好像也没现成调整原子顺序的脚本
原子顺序一样是建模的时候就需要考虑的问题,插完点后记得把结构都看一下
一般来讲的话,后面加的原子会出现在文件末尾,可以利用这一点




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