计算化学公社

标题: CP2K运行时内存使用率不高，求助内存使用设置 [打印本页]

作者
Author: jim 时间: 2023-5-16 18:33
标题: CP2K运行时内存使用率不高，求助内存使用设置
请教各位老师：我用MS构建了一个supercell，利用gview固定了底部某些原子（在此感谢sob老师提供的固定原子方法），inp文件（具体请见附件TiO2.inp）中设置了“ MAX_MEMORY 40000 #Memory(MB) per MPI process for calculating HF exchange”（Memory数值设置欠考虑），CP2K运行时内存使用率不高（使用情况请见截图“CPU RAM使用情况”，服务器配置：CPU 7R32*2；RAM 512G），请问如何提高CP2K运行时内存使用率（毕竟前面MAX_MEMORY 40000设置挺高，但实际使用率还是没上去）？如何设置才能使out文件中每个step计算时间缩短（目前正在计算中，把目前生成的out文件也贴出，目前每个step耗时要150s左右）？请各位老师不吝指教！谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2023-5-16 21:29
用popt版，甭用ssmp

输入文件还有个硬伤。当前用了SCREEN_ON_INITIAL_P T，应当读取纯泛函的wfn文件当初猜，否则结果基本没意义还几乎不能收敛，下文也明确说了
解决CP2K中SCF不收敛的方法
http://sobereva.com/665（http://bbs.keinsci.com/thread-37196-1-1.html）

作者
Author: jim 时间: 2023-5-16 22:01

sobereva 发表于 2023-5-16 21:29
用popt版，甭用ssmp

输入文件还有个硬伤。当前用了SCREEN_ON_INITIAL_P T，应当读取纯泛函的wfn文件当初 ...

谢谢sob老师！初看了665帖子，再看inp文件，发现inp文件中有一句是：
# SCF_GUESS RESTART #Use wavefunction from WFN_RESTART_FILE_NAME file as initial guess
&OT
也就是SCREEN_ON_INITIAL_P T与读取纯泛函的wfn文件并存？
想要“读取纯泛函的wfn文件当初猜”，请问如何调整inp文件？
另请教，有单分子用ssmp优化过了，请问还需用popt版再次优化吗？二者是否一致？

作者
Author: jim 时间: 2023-5-16 22:10
刚看了这个帖子：http://bbs.keinsci.com/thread-28312-1-1.html
先做纯泛函，然后再读取纯泛函的波函数进行杂化泛函计算，这样理解没错吧

作者
Author: sobereva 时间: 2023-5-16 22:24

jim 发表于 2023-5-16 22:01
谢谢sob老师！初看了665帖子，再看inp文件，发现inp文件中有一句是：
# SCF_GUESS RESTART #Use wav ...

不需要。一致

参考北京科音CP2K第一性原理计算培训班ppt

(, 下载次数 Times of downloads: 14)

作者
Author: sobereva 时间: 2023-5-16 22:24

jim 发表于 2023-5-16 22:10
刚看了这个帖子：http://bbs.keinsci.com/thread-28312-1-1.html
先做纯泛函，然后再读取纯泛函的波函数进 ...

没错

作者
Author: jim 时间: 2023-5-16 22:44
谢谢！

请问纯泛函计算时是否需要 2 DFT-D3(BJ)？不色散校正是否有影响？

作者
Author: jim 时间: 2023-5-17 22:00

sobereva 发表于 2023-5-16 22:24
没错

用Multiwfn将inp文件改为PBE，其余不便，PBE也不是很容易收敛啊，这都快一天了连“Decrease in energy = NO”状态都没变成YES，

真是忐忑

另外，CPU还是可以满载，内存还是只用到大约40G/512G，不知如何提高内存使用率

作者
Author: sobereva 时间: 2023-5-18 00:03

jim 发表于 2023-5-16 22:44
谢谢！请问纯泛函计算时是否需要 2 DFT-D3(BJ)？不色散校正是否有影响？

谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正？”
http://sobereva.com/413（http://bbs.keinsci.com/thread-9772-1-1.html）

作者
Author: sobereva 时间: 2023-5-18 00:04

jim 发表于 2023-5-17 22:00
用Multiwfn将inp文件改为PBE，其余不便，PBE也不是很容易收敛啊，这都快一天了连“Decrease in energy ...

分清楚SCF收敛和几何优化收敛
从来没说改成PBE就能让几何优化更容易收敛

内存该用多少用多少，自己确保运行方式、安装方式、输入文件合理就完了
不提供当下实际具体信息没法说

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