本人是CP2K新手,想计算一个质子+石墨烯结构的单点能 ,建模后使用Multiwfn非常方便地构建了输入文件结构,构建了20*20*60的盒子,并且设置了XY周期性,采用B3LYP方法进行计算,质子位于石墨烯上方很远处(25埃)。
现在输出文件有三个问题:
一是:WARNING:: No connections detected for Hydrogen - Atom Nr: 153 !
应该说的是质子没有与之相连的部分
二是:*** WARNING in dbcsr_mm.F:294 :: Using a non-square number of MPI ranks ***
*** might lead to poor performance. Used ranks: 23 Suggested: 25 49 ***
应该说的是没有使用并行
三是: *** WARNING in qs_scf.F:598 :: SCF run NOT converged ***
这是不收敛的问题,但是我觉得设的参数应该问题不大,我把文件已上传,还请各位不吝赐教! 作者Author: wzkchem5 时间: 2023-5-16 21:31
先确认几个问题:
(1)你确定你要算裸露的质子?注意但凡体系里有溶剂,质子必然不是裸露的,例如水溶液里质子应该按H3O+甚至H9O4+来算
(2)如果你确定你的质子是裸露的,那么你确定石墨烯不会把质子还原成氢原子?裸露的质子的氧化性是很强的,石墨烯的pi电子又比较容易给出来,因此石墨烯到质子可能会发生单电子转移作者Author: sobereva 时间: 2023-5-16 21:34
Z方向尺寸太小