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标题: Multiwfn如何考虑溶剂化效应对氢键强度的影响 [打印本页]

作者
Author: 社会主义小战士 时间: 2023-5-17 09:05
标题: Multiwfn如何考虑溶剂化效应对氢键强度的影响
如题。
各位前辈好！
如何考虑混合溶剂对分子间氢键的影响？
我的思路是在隐式溶剂模型下分别计算二聚体（有机分子，二聚体原子数460，元素C、H、O、N、S）的单点能，然后借助Multiwfn分析IGMH（http://sobereva.com/621），这样是否能体现出溶剂对氢键强度的影响呢？

程序：GAUSSIAN
方法/基组：B3LYP/def2TZVP em=GD3BJ scrf(read,solvent=generic) SP
设备：36物理核心、126GB内存

另外考虑到体系大小，用MOPAC在PM6-D3H4X MOZYME PRNT=2 EF eps=XXXXXXX precise charge=0先做了结构优化。

这里能否直接用MOPAC的优化后输出来分析？（不清楚Multiwfn能否支持？）
如果可以的话，那么半经验的结果能否用呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-5-17 11:00
Gaussian中B3LYP/def2TZVP算这个大小体系算不动，也没有理由非要用这个

如果隐式溶剂模型对结构有明显影响，用IGMH倒是能展现出溶剂效应的影响。但如果对结构影响微乎其微，IGMH一般不能明显体现出来什么，此时隐式溶剂模型对氢键强度的影响关键在于氢键结合和解离状态溶解自由能的变化

作者
Author: 社会主义小战士 时间: 2023-5-17 11:17

sobereva 发表于 2023-5-17 11:00
Gaussian中B3LYP/def2TZVP算这个大小体系算不动，也没有理由非要用这个

如果隐式溶剂模型对结构有明显影 ...

谢谢社长！

作者
Author: 社会主义小战士 时间: 2023-5-17 11:27

sobereva 发表于 2023-5-17 11:00
Gaussian中B3LYP/def2TZVP算这个大小体系算不动，也没有理由非要用这个

如果隐式溶剂模型对结构有明显影 ...

社长，我想多问一下，如果模型不是二聚体在不同溶剂条件下的计算，而是二聚体在真空中的氢键，以及单个分子与水之间的氢键，这样应该是能够根据IGMH的SCALE BAR体现不一样的强度吧？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-5-17 11:40

社会主义小战士发表于 2023-5-17 11:27
社长，我想多问一下，如果模型不是二聚体在不同溶剂条件下的计算，而是二聚体在真空中的氢键，以及单个分 ...

看不明白

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