计算化学公社

标题: 下面是我做了一个硼酸的水解机理，有一些问题，想请教一下公社里老师 [打印本页]

作者
Author: 18208408959 时间: 2023-5-17 20:07
标题: 下面是我做了一个硼酸的水解机理，有一些问题，想请教一下公社里老师
我是在# 6-311g** opt=(modredundant,maxcycle=200,gdiis) scrf=(solvent=water) iop(1/7=1200) M062x下原子12和13原理这样的方法扫出能量最高转折点，但是经过# M062x/6-311g** opt=(ts,calcfc,noeigentest,gdiis) freq=noraman scrf=(solvent=water) iop(1/7=1200)计算后发现不是我想要的过渡态，也一直找不到，想请教老师这种水解机理怎么找过渡态和计算，希望老师在万忙中看到的后回复，感谢

作者
Author: 18208408959 时间: 2023-5-17 20:20
这个是反应式

作者
Author: sobereva 时间: 2023-5-18 00:29
当前结构连过渡态的基本样子都没有，都没有即将形成/断裂的键，能优化到过渡态就怪了

随便举个像样的过渡态的例子

(, 下载次数 Times of downloads: 5)

多搜点硼酸衍生物水解相关文献，肯定早就有文章算过，看人家的过渡态长什么样

甭写多余的noraman，仔细看
常见的多余的和被滥用的Gaussian关键词
http://sobereva.com/331（http://bbs.keinsci.com/thread-3460-1-1.html）

作者
Author: dnlx 时间: 2023-5-18 06:44

18208408959 发表于 2023-5-17 20:20
这个是反应式

你想得到的过渡态，是个单步反应的过渡态，所以这里应该是协同反应，如同社长给的例子。但是你给的反应式，按其箭头，应该是个能垒更高的SN1反应，其第一步是大分子的异裂，水分子不直接参与，你那样摆放肯定有干扰。所以尽管你按照那个反应式来摆原子，摆出的并不是那个反应式的过渡态。

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2023-5-18 10:37

18208408959 发表于 2023-5-17 20:20
这个是反应式

这可能不是一步基元反应完成的

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-5-18 18:34
反应式里的催化剂H+为什么没有体现？

作者
Author: 18208408959 时间: 2023-5-19 15:36

sobereva 发表于 2023-5-18 00:29
当前结构连过渡态的基本样子都没有，都没有即将形成/断裂的键，能优化到过渡态就怪了

随便举个像样的过 ...

好的，谢谢老师点醒
，我已经找到了，非常感谢

作者
Author: 18208408959 时间: 2023-5-19 15:37

dnlx 发表于 2023-5-18 06:44
你想得到的过渡态，是个单步反应的过渡态，所以这里应该是协同反应，如同社长给的例子。但是你给的反应式 ...

我已经找到了，谢谢老师

作者
Author: 18208408959 时间: 2023-5-19 15:38

wzkchem5 发表于 2023-5-18 18:34
反应式里的催化剂H+为什么没有体现？

怎么体现带酸性H+，想请教老师解答一下

作者
Author: 18208408959 时间: 2023-5-19 15:38

liyuanhe211 发表于 2023-5-18 10:37
这可能不是一步基元反应完成的

好的，谢谢提醒

作者
Author: 18208408959 时间: 2023-5-19 15:44

18208408959 发表于 2023-5-19 15:37
我已经找到了，谢谢老师

我是在体系中加个水分子然后让氧硼键断开，水接在硼原子上，最后出现水分子的氢转移到苯环上的氧

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-5-19 16:18

18208408959 发表于 2023-5-19 08:38
怎么体现带酸性H+，想请教老师解答一下

自己随便找一些酸催化反应的计算文献，看看文献是怎么算的

作者
Author: 18208408959 时间: 2023-5-22 09:32

wzkchem5 发表于 2023-5-19 16:18
自己随便找一些酸催化反应的计算文献，看看文献是怎么算的

好的，谢谢

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