计算化学公社

标题: gromacs跑一个三明治体系崩溃,文件如附件 [打印本页]

作者
Author:
zyj19831206    时间: 2023-5-21 22:55
标题: gromacs跑一个三明治体系崩溃,文件如附件
体系跑完出现back off等字眼,不知道是不是能量最小化做的不够?
define = -DFLEXIBLE
integrator = cg
nsteps = 10000
emtol  = 100.0
emstep = 0.01
;
nstxout   = 100
nstlog    = 50
nstenergy = 50
;
pbc = xyz
cutoff-scheme            = Verlet
coulombtype              = PME
rcoulomb                 = 1.0
vdwtype                  = Cut-off
rvdw                     = 1.0
DispCorr                 = EnerPres
;
constraints              = none

这是em.mdp

作者
Author:
sobereva    时间: 2023-5-22 02:16
http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3