计算化学公社

标题: 哪个Linux发行版适合做计算呢？ [打印本页]

作者
Author: llity 时间: 2023-5-22 16:58
标题: 哪个Linux发行版适合做计算呢？
目前在虚拟机安装了archlinux和Ubuntu server，以前用过centos。各有优势，archlinux依靠AUR软件确实很丰富，很多软件在Ubuntu缺失需要自己编译安装。

主要做生物信息分析，anaconda、Python使用较多，Intel的CPU似乎更好点。archlinux的系统占用理论上更加可控，Ubuntu稳定性应该更好。

此外，尽管epyc更具性价比，我发现论坛里面用Intel的CPU更多吗？

大家主推哪种Linux版本呢？谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2023-5-22 17:08
Rocky Linux 9

作者
Author: hebrewsnabla 时间: 2023-5-22 17:09
你既然已经能自己装上archlinux，那（应该也能解决用它做计算时可能遇到的问题）可以自己体验体验看嘛。适合自己的才是最好的。

作者
Author: kimariyb 时间: 2023-5-22 21:17
私以为不滚动更新的 Rocky Linux 肯定最好，Arch Linux 虽然可以尝试很新的东西，但是不太稳定，我之前是用的 Arch Linux 做计算，对我来说我除了处理量化上的问题，还得抽出时间处理报错，很浪费时间。Debian 系的我自己在 WSL 上试过，也勉强能用，比 Arch Linux 稳定，起码 apt-get install 不会像 yay install 一样经常给你报各种各样的错，apt-get install 最多是来一句没找到相应的包，大部分时候只用无脑选 y 就行了。不过我自己目前用的是 Fedora Linux，由于 Fedora Linux 也算是红帽系，安装一些计算程序，还是能直接参考卢老师的操作，只是把 yum 改成 dnf 罢了。但是 Feodra 也是滚动更新，所以我打算换成 Rocky Linux 了，不过就像楼上老师说的一样，适合自己才是最好的。

作者
Author: llity 时间: 2023-5-22 23:30

sobereva 发表于 2023-5-22 17:08
Rocky Linux 9

那就和centos一样，这还是需要大量手工活，arch aur的软件真是覆盖了我大部分软件需要

作者
Author: llity 时间: 2023-5-22 23:30

hebrewsnabla 发表于 2023-5-22 17:09
你既然已经能自己装上archlinux，那（应该也能解决用它做计算时可能遇到的问题）可以自己体验体验看嘛。适 ...

主要就是aur的软件多，打包也方便维护。

作者
Author: llity 时间: 2023-5-22 23:31

kimariyb 发表于 2023-5-22 21:17
私以为不滚动更新的 Rocky Linux 肯定最好，Arch Linux 虽然可以尝试很新的东西，但是不太稳定，我之前是用 ...

Rocky 稳定性肯定好，archlinux就是需要经常滚动，时间久了可能滚挂，但是现在挂的概率很低了。

作者
Author: kimariyb 时间: 2023-5-23 10:59

llity 发表于 2023-5-22 23:31
Rocky 稳定性肯定好，archlinux就是需要经常滚动，时间久了可能滚挂，但是现在挂的概率很低了。

我之前用 Arch 的时候，之前都用得好好的，直到有一天突然就滚挂了。然后要去 wiki 和 google 上查报错，我就浪费了好多时间在这个上面。后面我就放弃了，不过我一个室友还是用的 Arch，我另外一个室友用的 Ubuntu，我自己用的 Fedora，三种情况都集齐了（因为我的专业是软工）。

作者
Author: abin 时间: 2023-5-23 11:26
本帖最后由 abin 于 2023-5-23 11:27 编辑

如果是想学习Linux
直接做LFS，Linux from scratch 。

如果Linux只是拿来作为干活的平台，
看看你用的软件支持那种发行版，可以减少很多折腾时间。

比如，常见的商用Linux平台的量化软件，
基本都支持RHEL。

用不起RHEL，就用它的衍生产品，比如Rocky, almaLinux等等。

工作生产环境，用滚动更新的发行版，都是真正的勇士。

鄙人在工作室的台式机，使用Ubuntu有八年……
使用Fedora桌面有四年……
珍惜生命，远离Linux图形界面。

目前推荐，MacBook Air作为干活的前端，
服务器使用RHEL兼容系统，只给网线和电源线，不开图形界面。

可以用Rocky .

作者
Author: kimariyb 时间: 2023-5-23 17:16

abin 发表于 2023-5-23 11:26
如果是想学习Linux
直接做LFS，Linux from scratch 。

老师，想问您几个问题。
1.  如果购买 Macbook Air， M1 的 16 + 256 是否是一个比较好的选择呢
2.  重所周知，行业内很多软件都不支持 Mac 系统，比如 Origin 等，那么平常使用 Origin 绘图是否应该在虚拟机上完成呢。
3.  如果使用虚拟机，M1 下开 Win 的虚拟机会有兼容性的问题吗。期待老师您的解答。

作者
Author: abin 时间: 2023-5-23 21:30

kimariyb 发表于 2023-5-23 17:16
老师，想问您几个问题。
1. 如果购买 Macbook Air， M1 的 16 + 256 是否是一个比较好的选择呢
2. 重 ...

做计算用哪一个Linux?
我都是默认, 在服务器上跑计算, 那么使用Rocky吧.

如果有钱, 使用RHEL吧.

我自己是把Mac当作“兼容Linux指令行+拥有稳定图形界面”来用的.

你所谓“重所周知”的那些软件, 鄙人用不到, 不晓得. 我用gnuplot + python

虚拟机呀, 你问Parallel Desktop吧, 不过需要付费的.

我理解的“哪个Linux发行版适合做计算”, 是, 讨论, 计算服务器采用哪一个Linux系统比较合适?

目前的推荐是Rocky.

至于笔记本或者自己使用的机器,
如没有特殊要求, 你还是用微软吧.
如果非要使用Linux系统, 除非你不涉及中文输入, 以及腾讯系列、百度系列应用, 还有微软Office系列应用.

我虽然使用Linux多年(桌面版),
但是我从来不在上面处理任何中文相关的内容.

你要是在Linux桌面不折腾中文相关内容, 还凑合用.
但是GUI的bug还是不少的, 不建议折腾.

我用的Mac机器, 基本都是1TB磁盘的.
如果你仅仅存放输入文件,以及文本文件, 20GB都够用了.

作者
Author: comchem 时间: 2023-6-18 10:51
opensuse是一个不错的选择，有一个yast工具，使得各种系统设置变得很简单。

作者
Author: 啊不错的飞过海 时间: 2023-6-19 02:09
买新平台的话epyc确实香，坛里近一两年也有不少人上。
不过前epyc时代intel的出货量很大，到现在也有不少积累，洋垃圾至强也在epyc一二代价格没下来时候风行过，至今留在sob老师的推荐装机配置单里。intel在2022年之前还有个优势是支持AVX512，amd侧直到去年底开卖的zen4才追上。intel本代起开始搞面向AI的SIMD指令集AMX，和量化口需求相关不大，预计未来几年内intel占有率还得跌一跌，钱够的话本代epyc就不赖。

作者
Author: 万里云 时间: 2023-6-26 15:50
现在红帽幺蛾子不断，连带Rock/Alma等一众衍生版前途未卜。为稳妥还是用Debian Stable。

openSUSE Leap各方面都不错，但每年都要升级版本。单台服务器无所谓，集群升级工作量很大。

Ubuntu就是个网红系统，完美符合网红的特征：喜欢整烂活儿，其实技术不咋滴。

作者
Author: llity 时间: 2023-7-6 17:18

abin 发表于 2023-5-23 11:26
如果是想学习Linux
直接做LFS，Linux from scratch 。

谢谢建议，目前安装了Ubuntu和Rocky
主力使用Ubuntu和同学一起，和Rocky比起来Ubuntu server也使用也多起来了

而且很多软件有二进制分发倒也方便很多，打算自己把Rocky的环境搭建起来使用。
之前获得的信息一直是centos的软件几乎不更新，给我的感觉就是固化了，大部分系统也都停留在centos7，
希望Rocky别被收购了

最近也是用MBA做前端干活

谢谢

作者
Author: xexlalalan 时间: 2023-7-6 19:32

kimariyb 发表于 2023-5-23 17:16
老师，想问您几个问题。
1. 如果购买 Macbook Air， M1 的 16 + 256 是否是一个比较好的选择呢
2. 重 ...

顺带一说，OriginLab在Mac上运行有雷。苹果自家的CPU就算安虚拟机也跑不了Origin

作者
Author: llity 时间: 2023-7-6 21:26
本帖最后由 llity 于 2023-7-6 22:35 编辑

万里云发表于 2023-6-26 15:50
现在红帽幺蛾子不断，连带Rock/Alma等一众衍生版前途未卜。为稳妥还是用Debian Stable。

openSUSE Leap ...

系统是社区版应该问题不大吧

希望Rocky能坚持住

红帽拒绝被“白嫖”，限制 RHEL 源码访问，下游发行版反抗：别担心，我找到了两种新方法！..._CSDN资讯的博客-CSDN博客
整理| 屠敏出品 | CSDN（ID：CSDNnews）当前，一方面，关于红帽决定停止向非客户免费分发 RHEL（Red Hat Enterprise Linux）源代码的争议依然在持续。另一方面，红帽这条新规惹得AlmaLinux、Rocky Linux 等 RHEL 下游发行版不满之际，后者还是在马不停蹄地寻找出路。这不，短短一周后，CentOS 的创始人 Gregory Kurtzer

https://blog.csdn.net/csdnnews/article/details/131485741

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)