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标题: ESP分析数据提取问题 [打印本页]

作者
Author: HERO 时间: 2016-7-17 19:42
标题: ESP分析数据提取问题
各位大侠，在做ESP分析时，如图一，分辨不清楚那个极值点对应的位置，即构型翻转时对应的极值点位置发生变化。例如：想要讨论羟基中氢附近的静电势在激发前后发生怎样的变化，怎样确定氢对应的极值点是哪个？另外，是否可以选项11中读出每个原子对应的静电势值，在图二和图三中，哪些值可以用来讨论静电势值的变化。谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2016-7-20 12:32
图形界面右侧把ratio of atomic size设为4.0，此时原子球对应于原子范德华半径，这样就能比较容易看出原子和极值点的位置对应关系了

对于原子，从分子表面静电势分析的角度上只能说原子露在表面区域的静电势平均值（图3的all那列）、方差等等，要考察原子在两个电子态间原子的电荷改变量最好用原子电荷的变化来考察

作者
Author: HERO 时间: 2016-7-27 08:46

sobereva 发表于 2016-7-20 12:32
图形界面右侧把ratio of atomic size设为4.0，此时原子球对应于原子范德华半径，这样就能比较容易看出原子 ...

谢谢sob。之前就把ratio of atomic size设为4.0，因为构型不平面，调整下角度发现对应点变化了，对此很郁闷，并不确定位置，本来想要在输出数据中查找，这样更加精确些。请问下图二中每个原子对应的Minimal value 和Maximal value 是啥意思？是该原子附近的ESP最小和最大值？谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2016-7-27 12:35

HERO 发表于 2016-7-27 08:46
谢谢sob。之前就把ratio of atomic size设为4.0，因为构型不平面，调整下角度发现对应点变化了，对此很郁 ...

图2里统计的都是分子表面中对应于各个原子的局部表面上的静电势统计量，所以显然minimal和maximal value就是原子局部表面上的静电势最小值和最大值。

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