计算化学公社

标题: 想请教下以下这种错误是软件的问题吗？ [打印本页]

作者
Author: ShineZhu 时间: 2023-5-23 15:38
标题: 想请教下以下这种错误是软件的问题吗？
最近我在我们服务器上使用GMX-2023总是遇到以下这个错误，想请教下这个错误是属于这个新版GMX的bug还是就是我自己没有正确使用软件对其进行合理的input呢。想请教下各位有经验的前辈们，希望可以得到您们的一些意见，谢谢。以下截图是报错信息，附件是我input的文件。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-5-24 01:25
运行方式不对。如果前面带了mpirun，去掉
如果没带，重新编译GROMACS，不跨节点甭用MPI版，否则自取其辱

作者
Author: ShineZhu 时间: 2023-5-24 10:39

sobereva 发表于 2023-5-24 01:25
运行方式不对。如果前面带了mpirun，去掉
如果没带，重新编译GROMACS，不跨节点甭用MPI版，否则自取其辱

老师您好，我运行前面没有带mpirun。安装是给我们实验室安装服务器的工程师安装的2023版，您的意思是需要重新下载安装GMX吗

作者
Author: sobereva 时间: 2023-5-26 05:00

ShineZhu 发表于 2023-5-24 10:39
老师您好，我运行前面没有带mpirun。安装是给我们实验室安装服务器的工程师安装的2023版，您的意思是需要 ...

是
参考下文
GROMACS的安装方法（含全程视频演示）
http://sobereva.com/457（http://bbs.keinsci.com/thread-11821-1-1.html）

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