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标题: 求助：把gro文件不同残基分别保存 [打印本页]

作者
Author: sj12138 时间: 2023-5-23 16:11
标题: 求助：把gro文件不同残基分别保存
老师您好，我想知道gromacs能否使用editconf命令将一个gro文件中的不同部分分别保存吗？
比如我的gro文件中有水分子有蛋白分子有离子，然后我想把gro文件中的水分子单独保存成一个gro文件，蛋白分子和离子单独保存一个gro应该怎么实现那？
感谢各位前辈的指导

作者
Author: pal 时间: 2023-5-23 16:51
我会直接grep

作者
Author: sj12138 时间: 2023-5-23 17:45

pal 发表于 2023-5-23 16:51
我会直接grep

啊，原来是这么解决的吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-5-24 01:27
gmx editconf的时候-n接上索引文件，选择保存出来的部分对应的组
或者gro载入VMD，save coordinate保存gro的时候用选择语句选择对应的部分，参考
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

作者
Author: sj12138 时间: 2023-5-24 13:58

sobereva 发表于 2023-5-24 01:27
gmx editconf的时候-n接上索引文件，选择保存出来的部分对应的组
或者gro载入VMD，save coordinate保存gro ...

好的，谢谢sob老师，我去试一试

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