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标题: 求助：关于chemtrayzer使用过程中的问题 [打印本页]

作者
Author: yusin 时间: 2023-5-25 16:22
标题: 求助：关于chemtrayzer使用过程中的问题
各位前辈好！
我在使用python analyzing.py examples/bonds.tatb.reac这条命令时，提示如下:
这里的WARNING: number of atoms vary between 0 and 7是什么意思？在运行这条命令时也没有新的文件产生，我看自述文件说，运行了这条命令会产生一些新的文件，为啥我的没有产生啊

。
另外自述文件里在使用这条命令时是这样的： python analyzing.py bonds.tatb.reac -main reac -dp 0.1 -gen id
请问加上的-main reac -dp 0.1 -gen id是表示什么意思？

作者
Author: cyx98 时间: 2023-5-25 19:35
在windows下使用要安装其他的一些软件。
python 2.7; openbabel 2.4.0; numpy; pygraph; matplotlib 等
所以我之前是在linux上安装的，正常结束是 DONE: mechanism written to reac.gml and reactions written to reac.tex

作者
Author: yusin 时间: 2023-5-26 10:48
本帖最后由 yusin 于 2023-5-26 10:51 编辑

cyx98 发表于 2023-5-25 19:35
在windows下使用要安装其他的一些软件。
python 2.7; openbabel 2.4.0; numpy; pygraph; matplotlib 等
...

感谢前辈的解答！
如前辈所说，我用的是Windows，也安装了python 2.7; openbabel 2.4.0; numpy; pygraph; matplotlib 等，我又尝试运行，现在有几个问题想请教前辈：
1、运行结束时是DONE: mechanism written to reac.gml and reactions written to
reac.tex，如图1，但是运行结束时仍然没有任何文件产生，这是为啥呀？
2、运行过程中出现（如图1、2）
[H] ---> reac.pic/spec_8.png
1 molecule converted
无效参数 - 1200
无效参数 - 30x30
无效参数 - 10%
这是什么呀？
3、WARNING: number of atoms vary between 0 and 7这里提示的警告是什么呀？（如图2） (, 下载次数 Times of downloads: 7)

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