计算化学公社

标题: 请教：如何用MS构造一个球形结构 [打印本页]

作者
Author: PHOENIXHMX 时间: 2023-5-25 17:37
标题: 请教：如何用MS构造一个球形结构
我需要构建一个Au的球形结构，用MS可以构建吗？如果可以的话方法是什么呢？或是用别的软件可以完成构建。期待各位老师指教

作者
Author: naoki 时间: 2023-5-25 18:14
用M$自带的金晶体扩胞到你想要的尺寸，构建个超胞并导出文件，交给VMD通过TCL语言选择球形区域再导出。具体怎么选球形区，用论坛搜索框搜TCL看看

作者
Author: PHOENIXHMX 时间: 2023-5-25 18:36

naoki 发表于 2023-5-25 18:14
用M$自带的金晶体扩胞到你想要的尺寸，构建个超胞并导出文件，交给VMD通过TCL语言选择球形区域再导出。具体 ...

好的，感谢回复，我去试一下

作者
Author: pal 时间: 2023-5-25 19:26
http://sobereva.com/153 可以参照这里的建模

作者
Author: sobereva 时间: 2023-5-26 02:23
选择语句看
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

只要是选择语句能选择出来的，靠VMD就都能保存出相应形状的团簇

作者
Author: PHOENIXHMX 时间: 2023-5-26 08:19

sobereva 发表于 2023-5-26 02:23
选择语句看
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14 ...

感谢sob老师的回复，已成功构建出来了

作者
Author: PHOENIXHMX 时间: 2023-5-26 08:19

pal 发表于 2023-5-25 19:26
http://sobereva.com/153 可以参照这里的建模

好的，感谢回复

作者
Author: jisuanbeginner 时间: 2023-12-22 09:18

sobereva 发表于 2023-5-26 02:23
选择语句看
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14 ...

Sobereva老师，您好。请教一下：C60富勒烯这种结构，以及将二维材料卷曲成棒、管、球，如何建模，谢谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-22 16:02

jisuanbeginner 发表于 2023-12-22 09:18
Sobereva老师，您好。请教一下：C60富勒烯这种结构，以及将二维材料卷曲成棒、管、球，如何建模，谢谢。

C60在gview自带的片段库里就有，nanotube modeler自带的富勒烯库里也有

如果是构造氮化硼、纯碳纳米管，VMD就有现成的工具。如果是任意的二维材料卷起来，我不清楚

作者
Author: jisuanbeginner 时间: 2023-12-24 09:10

sobereva 发表于 2023-12-22 16:02
C60在gview自带的片段库里就有，nanotube modeler自带的富勒烯库里也有

如果是构造氮化硼、纯碳纳米管 ...

好的，谢谢社长老师

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