计算化学公社

标题: 不知道是不是安装的ORCA 有问题 还是MPI?或者服务器其他问题 [打印本页]

作者
Author:
valentino_bo    时间: 2023-5-25 17:51
标题: 不知道是不是安装的ORCA 有问题 还是MPI?或者服务器其他问题
如题,不知道是不是安装成功了ORCA, 不知道中止的原因是什么?求问

作者
Author:
wzkchem5    时间: 2023-5-25 18:32
比较可能是openmpi没装对
作者
Author:
sobereva    时间: 2023-5-26 02:24
没装MPI库,或者当前活动状态的不是OpenMPI而是诸如Intel MPI,或者用的不是当前ORCA版本兼容的OpenMPI版本
作者
Author:
valentino_bo    时间: 2023-5-26 11:32
sobereva 发表于 2023-5-26 02:24
没装MPI库,或者当前活动状态的不是OpenMPI而是诸如Intel MPI,或者用的不是当前ORCA版本兼容的OpenMPI版本

感谢回答,正在寻找问题,安装了最新的OPENMPI 4.1.1,取运行ORCA 还是有问题,还在寻找解决办法
作者
Author:
valentino_bo    时间: 2023-5-26 11:47
可以把前文的$PATH:/sob/openmpi411/bin改为/sob/openmpi411/bin:$PATH、把$LD_LIBRARY_PATH:/sob/openmpi411/lib改为/sob/openmpi411/lib:$LD_LIBRARY_PATH,  参考了这个  ,然后可以运行了
作者
Author:
kimariyb    时间: 2023-5-27 23:35
本帖最后由 kimariyb 于 2023-5-27 23:52 编辑
valentino_bo 发表于 2023-5-26 11:47
可以把前文的$PATH:/sob/openmpi411/bin改为/sob/openmpi411/bin:$PATH、把$LD_LIBRARY_PATH:/sob/openmpi4 ...

楼主,你所说的这个东西,如果你从来没有配置过,$PATH写前面和后面,执行的结果应该是一样的。写前面和后面的区别,主要是 Linux 系统读取配置文件的顺序不同所导致的。

  1. # openMPI
  2. export PATH=$PATH:/home/kimariyb/orca/openmpi-4.1.1/bin
  3. export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/kimariyb/orca/openmpi-4.1.1/lib
  4. # orca
  5. export PATH=$PATH:/home/kimariyb/orca/orca5
  6. export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/kimariyb/orca/orca5
复制代码

我这样配置,照样也能运行。如果如你所说你把 $PATH 写前面运行出错,应该是服务器之前有过别的的配置,导致 Linux 没有读取你的新配置,不过楼主也不必认为 $PATH 写在前面就是错误写法,如果是一台全新的机子,并且系统够干净,写前面和后面应该是没区别的。

作者
Author:
valentino_bo    时间: 2023-6-1 09:53
kimariyb 发表于 2023-5-27 23:35
楼主,你所说的这个东西,如果你从来没有配置过,$PATH写前面和后面,执行的结果应该是一样的。写前面和 ...

对的, 是服务器本来之前就有intel MPI 。




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3