计算化学公社

标题: Gview做不出ESP静电势图,谢谢! [打印本页]

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lao7    时间: 2016-7-19 08:22
标题: Gview做不出ESP静电势图,谢谢!
看到Sob的帖子:http://sobereva.com/253里面用Gview作静电势图的方法,linux平台下计算结果并生成fchk文件,然后通过如下介绍不步骤:
“用gview打开dopamine.fchk,选Results-Surfaces/Contours。点Cube Actions-New Cube”,在Cube Actions下面一步,New Cube是灰色的,无法操作。只有一个load cube可以操作,咋回事呢?请懂的指导一下,谢谢!


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数据挖掘    时间: 2016-7-19 12:17
需要在win下面安装gaussian 软件, 计算cube,是要调用高斯程序的,gview 不带计算功能。
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sobereva    时间: 2016-7-20 10:20
安装gview前必须装Gaussian,这样gview才能找到Gaussian的路径。按博文步骤计算静电势的时候gview会自动调用Gaussian目录下的cubegen产生电子密度格点数据,并计算等值面上的静电势数值。光有个gview做不到和波函数有关的任何分析处理。
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lao7    时间: 2016-7-27 10:17
谢谢,我再次试试。
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杨小狗    时间: 2016-7-27 15:39
将fchk文件打开,查找里边的independent改成independant
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lao7    时间: 2016-8-22 12:49
杨小狗 发表于 2016-7-27 15:39
将fchk文件打开,查找里边的independent改成independant

谢谢,弄好了!
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Dawn~    时间: 2019-7-1 11:04
同学,你好!我跟你遇到一样的问题,而且进行  “将fchk文件打开,查找里边的independent改成independant” 操作之后,仍然不行,请问你最后是怎么解决的?谢谢!
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sobereva    时间: 2019-7-1 11:13
Dawn~ 发表于 2019-7-1 11:04
同学,你好!我跟你遇到一样的问题,而且进行  “将fchk文件打开,查找里边的independent改成independant” ...

改用Multiwfn+VMD好得多,效果更好,速度更快,完全免费
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)
http://sobereva.com/443http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html

若死活非要用gview绘制,把fch文件载入Multiwfn,选择主功能100的子功能2,导出fch,然后再试图载入gview
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Dawn~    时间: 2019-7-2 10:16
sobereva 发表于 2019-7-1 11:13
改用Multiwfn+VMD好得多,效果更好,速度更快,完全免费
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范 ...

看到sob老师的回复了,我昨天用同学的电脑上的gview是可以做,自己电脑上的gview怎么都不行。请问sob老师又multiwfn的安装包吗?

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sobereva    时间: 2019-7-2 10:40
Dawn~ 发表于 2019-7-2 10:16
看到sob老师的回复了,我昨天用同学的电脑上的gview是可以做,自己电脑上的gview怎么都不行。请问sob老师 ...

博文里一开始就写了Multiwfn的主页是什么,去那里下啊,为什么要求安装包,又不是收费的,又不是网站访问不了,又不是给没网址(况且随便哪个搜索引擎搜Multiwfn都能马上找到主页)
我的论坛签名里也明确写明了Multiwfn的主页,本论坛还有专门Multiwfn板块,里面置顶帖也明确给了下载地址。

从此放弃gview绘制静电势图就完了

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bufanzhi    时间: 2019-9-6 09:56

(, 下载次数 Times of downloads: 37) 请问这种静电势图怎么画?请具体一点,谢谢!
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sobereva    时间: 2019-9-7 02:25
bufanzhi 发表于 2019-9-6 09:56
请问这种静电势图怎么画?请具体一点,谢谢!

这个图毫无意义,是典型“错误的示范”,一看就知道绘制的人要么基本步骤搞错了,要么等值面数值胡设

怎么正确绘制在这里已经写明了
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)
http://sobereva.com/443http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html

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bufanzhi    时间: 2019-9-9 13:56
sobereva 发表于 2019-9-7 02:25
这个图毫无意义,是典型“错误的示范”,一看就知道绘制的人要么基本步骤搞错了,要么等值面数值胡设

...

谢谢sob老师解答~




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