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标题: NAMD的配置文件(.conf)文件中cellBasisVector1和cellOrigin如何确定？ [打印本页]

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Author: xiayu1985 时间: 2023-5-31 21:45
标题: NAMD的配置文件(.conf)文件中cellBasisVector1和cellOrigin如何确定？
.conf文件中有三个vector，cellBasisVector1，cellBasisVector2，cellBasisVecto3这三个数值是如何得到的？namd tutorial中说通过命令measure minmax $pdb得到min，max两组数值，但是我发现tutorial中的cellorigin的数值并不精确的等于（min+max）/2，为什么？这儿不解的还有两个问题，min,max两组数据指什么，有什么意义？cellorigin的数值指什么？有何意义？

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