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标题: amber DNA力场的选择求助 [打印本页]

作者
Author: lauowan 时间: 2023-6-1 17:19
标题: amber DNA力场的选择求助
我想用amber做一个羰基化酶和DNA复合物的MD，DNA中关键位点是一个次黄嘌呤，但是选择DNA.OL15和DNA.bsc1力场时没有对ATCG以外残基的描述。请问大家一般做有修饰碱基的DNA一般用什么力场呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-2 01:25
搜文献，如果没有现成的，就在原AMBER力场基础上自己改

作者
Author: lauowan 时间: 2023-6-2 09:37

sobereva 发表于 2023-6-2 01:25
搜文献，如果没有现成的，就在原AMBER力场基础上自己改

好的，谢谢sob老师

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