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标题: 求助一个小分子计算出来的ECD光谱和实验测得ECD光谱有很大差别 [打印本页]

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Author: hzsHZS 时间: 2023-6-1 20:18
标题: 求助一个小分子计算出来的ECD光谱和实验测得ECD光谱有很大差别
在计算一个小分子的ECD时，计算出来的ECD光谱和实验测得ECD光谱有很大差别，但不知道哪里有问题，请大家帮我看一下

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Author: wzkchem5 时间: 2023-6-1 20:51
本帖最后由 wzkchem5 于 2023-6-1 14:26 编辑

200-230nm实验没有峰可能是因为实验仪器问题，如果绝大部分光被溶质或溶剂吸收，可能因为检测器信噪比有限，本来有CD信号的区域会测出几乎没有CD信号。我算过有的体系在溶剂截止波长以下有峰，但实验是像你这样的信号接近0且噪音很大。
排除实验问题后，剩下的问题就是你的计算最好加弥散函数，因为高激发态有Rydberg成分；最好尝试一下范围分离泛函，因为你的共轭体系可能有电荷转移激发；再者就是考虑做显式溶剂化。另外这个分子可能有tautomer，就是烯醇羟基氢电离下来以后接到羰基氧上的结构，如果没有考虑的话可以考虑一下试试

作者
Author: hzsHZS 时间: 2023-6-1 22:12
感谢老师，这是我刚刚修改的输入文件，可以帮忙看下吗，因为范围分离泛函的知识不是很懂。如果这次模拟的还不是很好的话，我再考虑一下互变异构体的情况。

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Author: sobereva 时间: 2023-6-1 23:18
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “ECD光谱模拟” 改了，以后务必注意，下次将删帖+扣分处理。

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Author: wzkchem5 时间: 2023-6-2 00:04

hzsHZS 发表于 2023-6-1 15:12
感谢老师，这是我刚刚修改的输入文件，可以帮忙看下吗，因为范围分离泛函的知识不是很懂。如果这次模拟的还 ...

我不知道高斯是否支持LC-wPBE的色散校正，如果不支持的话去掉em=gd3bj（本来色散校正对激发能也没有影响，没必要加，但假如程序支持这个泛函的色散校正，那么加了也不算错）。其他应该没问题

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Author: sobereva 时间: 2023-6-2 05:44
单独用lc-wPBE而不做w调控的话通常也没什么好处，建议先考虑CAM-B3LYP
另外，每个主要构象的ECD应当分别贴出来

作者
Author: hzsHZS 时间: 2023-6-2 09:47

wzkchem5 发表于 2023-6-2 00:04
我不知道高斯是否支持LC-wPBE的色散校正，如果不支持的话去掉em=gd3bj（本来色散校正对激发能也没有影响 ...

谢谢老师

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Author: hzsHZS 时间: 2023-6-2 09:48

sobereva 发表于 2023-6-1 23:18
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

好的，sob老师，下次注意

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