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标题: forcite模块，小分子不与磷脂膜作用 [打印本页]

作者
Author: marstt 时间: 2023-6-1 22:01
标题: forcite模块，小分子不与磷脂膜作用
我是想看有机小分子在膜法向上的分布，判断它和膜的亲和力。建的一个长方体盒子，单层磷脂层放在底部，头部朝z轴尾部加限制，forcite跑动力学发现部分水分子结合在磷脂头部，而有机小分子形成水化层不与膜结合，希望能得到解答。初次发帖，初次计算，请多包涵。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-1 23:45
我不知道你用的什么力场。Forcite里直接能用的力场没有任何一个适合这种体系，估计你的计算的基本出发点就是错的
跑磷脂膜体系必须用专用的力场，诸如Slipid、Kukol、CHARMM36等等

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