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标题: packmol 怎么将粒子填充到圆柱体里 [打印本页]

作者
Author: 打豆豆的灰鸭 时间: 2023-6-5 15:57
标题: packmol 怎么将粒子填充到圆柱体里
本帖最后由打豆豆的灰鸭于 2023-6-6 10:13 编辑

q1:packmol 怎么将粒子填充到圆柱体里，（圆柱体盒子）图片中61是盒子长度，7是半径。

q2:我在ms建立一个惰性原子的纳米管，怎么用packmol将粒子填充进去

[attach]69389[/attach] (, 下载次数 Times of downloads: 20) (, 下载次数 Times of downloads: 19) (, 下载次数 Times of downloads: 19)

作者
Author: 牧生 时间: 2023-6-5 17:00
http://sobereva.com/473

你会找到灵感的

作者
Author: 打豆豆的灰鸭 时间: 2023-6-6 09:01

牧生发表于 2023-6-5 17:00
http://sobereva.com/473

你会找到灵感的

按这个来的有报错，想问问怎么正确设置

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-6 10:05
packmol不支持输出gro文件

并且放宽插入的范围反复尝试弄清楚情况

作者
Author: 打豆豆的灰鸭 时间: 2023-6-6 10:11

sobereva 发表于 2023-6-6 10:05
packmol不支持输出gro文件

并且放宽插入的范围反复尝试弄清楚情况

老师，这个问题解决了，我用packmol 建的圆柱盒子，在vmd打开是长方形，是显示问题还是别的，我把修改后的。inp文件贴在原帖上，老师看一下

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