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标题: 求助分子动力学之后分析的径向分布函数只有上升的趋势 [打印本页]

作者
Author: 沉淀淀 时间: 2023-6-6 15:09
标题: 求助分子动力学之后分析的径向分布函数只有上升的趋势
请问各位老师，我这个分子动力学之后分析的径向分布函数只有上升的趋势，我看文献里面都是有下降的部分，这是出什么问题了呀
附，参考文献：

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-6 16:14
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “径向分布函数绘制” 改了，以后务必注意

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-7 13:24
取决于具体怎么统计的。
应当只考虑距离N最近的Co。否则随着r增大，距离N的球层内Co原子越来越多，显然这样的rdf没法说明问题

作者
Author: 沉淀淀 时间: 2023-6-19 19:48

sobereva 发表于 2023-6-6 16:14
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

好的sobereva老师，我以后发帖的时候一定注意

作者
Author: 沉淀淀 时间: 2023-6-19 19:54
本帖最后由沉淀淀于 2023-6-19 19:56 编辑

sobereva 发表于 2023-6-7 13:24
取决于具体怎么统计的。
应当只考虑距离N最近的Co。否则随着r增大，距离N的球层内Co原子越来越多，显然这 ...

老师，还有一个就是我的MD模拟的结果，那些缓蚀剂分子距离Co层都很远，没有像文献一样吸附在Co的表面，是怎么回事呀，就是很多帧大概是这个样子的，而文献中最后一帧都是停留在Co的表面
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作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-19 20:55

沉淀淀发表于 2023-6-19 19:54
老师，还有一个就是我的MD模拟的结果，那些缓蚀剂分子距离Co层都很远，没有像文献一样吸附在Co的表面，是 ...

力场参数、模拟设置、初始结构等差异都可能导致

作者
Author: 沉淀淀 时间: 2023-6-23 20:51

sobereva 发表于 2023-6-7 13:24
取决于具体怎么统计的。
应当只考虑距离N最近的Co。否则随着r增大，距离N的球层内Co原子越来越多，显然这 ...

老师，请问一下那个距离N最近的Co怎么选择呀，是第一层中间的Co嘛

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