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标题: ORCA中如何进行NEB的续算 [打印本页]

作者
Author: tsgyls 时间: 2023-6-7 11:40
标题: ORCA中如何进行NEB的续算
本帖最后由 tsgyls 于 2023-6-7 17:06 编辑

之前算的neb意外终止，想要续算，看手册说用
Restart_ALLXYZFile "NEB1.allxyz" 这个关键词
(, 下载次数 Times of downloads: 18)
我想着的是把initial_path_trj.xyz文件里的结构放到ALLXYZ里，然后用这个关键词
但是ORCA会报错
(, 下载次数 Times of downloads: 19)
感觉我并没有理解开发者的意思
想请问一下大家续算neb的正确操作是怎么样的
ORCA输入的关键词
!PBE0 D3 6-31G** CPCM(TOLUENE) TightSCF TightOpt
!NEB
%neb
neb_end_xyzfile "final.xyz"
Restart_ALLXYZFile "NEB1.allxyz"
end

已解决，手册与软件版本不同导致的报错，改正后可正常计算

作者
Author: Freeman 时间: 2023-6-7 11:48
本帖最后由 Freeman 于 2023-6-7 11:50 编辑

可能是因为neb和opt关键词不兼容。请贴一下报错信息。

作者
Author: tsgyls 时间: 2023-6-7 14:10

Freeman 发表于 2023-6-7 11:48
可能是因为neb和opt关键词不兼容。请贴一下报错信息。

感谢您，报错信息我贴在一楼了，就是未识别关键词

[file orca_tools/Tool-Scanner/qcscan1.cpp, line 102]:
Unknown identifier in NEB block line 5 :
Last token : RESTART_ALLXYZFILE

作者
Author: Freeman 时间: 2023-6-7 15:42

tsgyls 发表于 2023-6-7 14:10
感谢您，报错信息我贴在一楼了，就是未识别关键词

[file orca_tools/Tool-Scanner/qcscan1.cpp, line ...

这么看，报错信息也许是.allxyz文件格式不对。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-6-7 15:49

tsgyls 发表于 2023-6-7 07:10
感谢您，报错信息我贴在一楼了，就是未识别关键词

[file orca_tools/Tool-Scanner/qcscan1.cpp, line ...

这种报错表示程序不认识RESTART_ALLXYZFILE这个关键词（如果allxyz文件格式错误，报错信息不会这么写）。但鉴于orca手册里提到了这个关键词，程序不应该不认识。会不会是你跑的orca版本太低，比orca手册的版本低？如果不是的话，可能是程序的bug，可以在orca论坛上发个帖

作者
Author: tsgyls 时间: 2023-6-7 17:05

wzkchem5 发表于 2023-6-7 15:49
这种报错表示程序不认识RESTART_ALLXYZFILE这个关键词（如果allxyz文件格式错误，报错信息不会这么写）。 ...

感谢解答，就是版本的问题，节点上装了两个版本所以出错了，改正后就没有报错了

作者
Author: tsgyls 时间: 2023-6-7 17:07

Freeman 发表于 2023-6-7 15:42
这么看，报错信息也许是.allxyz文件格式不对。

是手册和软件版本不同导致的问题，改正后就可以正常计算

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