计算化学公社

标题: 软件用lammps，想买两台服务器，求建议 [打印本页]

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Author: Sun-2022 时间: 2023-6-7 20:11
标题: 软件用lammps，想买两台服务器，求建议
组里确定了使用MD的研究方法，我和我师兄主做，软件用的lammps，研究模拟体系几万个原子起步。现在准备购置两台服务器，整体预算6W内。一台想用GPU加速，配置打算上7950X+4090。另一台想上个双路CPU，配置打算上8375C*2。想法就是两台比较着使用一下，想问问各位有过使用经验的大佬们这想法可行吗？因为我看网上说用GPU加速算的效率比用CPU高很多，怕到时候买了双路服务器浪费掉。

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2023-6-7 22:37
逐句、仔细阅读 http://bbs.keinsci.com/thread-35988-1-1.html

刚刚特意为你做了更新。
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作者
Author: Kmetsch 时间: 2023-6-7 23:25
需要考虑你要用哪种力场，有的力场不支持kokkos加速。如果支持的话，可以上两台7950X+2*4090
另外还有一种很邪道的搭配方式，就是双路服务器插个六到八张P100，不考虑P100报销困难和踩雷的问题的话，性价比极高。

作者
Author: Sun-2022 时间: 2023-6-7 23:37

Entropy.S.I 发表于 2023-6-7 22:37
逐句、仔细阅读 http://bbs.keinsci.com/thread-35988-1-1.html

刚刚特意为你做了更新。

好的！谢谢老师！！！

作者
Author: Sun-2022 时间: 2023-6-7 23:38

Kmetsch 发表于 2023-6-7 23:25
需要考虑你要用哪种力场，有的力场不支持kokkos加速。如果支持的话，可以上两台7950X+2*4090
另外还有一种 ...

力场应该是用ReaxFF

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2023-6-7 23:41
本帖最后由 Entropy.S.I 于 2023-6-8 01:50 编辑

Kmetsch 发表于 2023-6-7 23:25
需要考虑你要用哪种力场，有的力场不支持kokkos加速。如果支持的话，可以上两台7950X+2*4090
另外还有一种 ...

7950X只在用不是纯GPU方案的“GPU”包时，或有可能用到不支持GPU加速的pair_style时，才有必要配。

7600X，B650平台，就能搭5块P100，用PCIe拆分就行了，GPU各跑各的Kokkos加速lmp任务时，对CPU-GPU通信需求非常低，PCIe Gen3 x4足够。这种方案也是有现成的机箱的。

当然，5600X配B550也是可以的，只不过目前这套的价格并没有比7600X+B650便宜很多。

让每块卡都获得全速PCIe连接，只有在需要多卡跑单任务是才有必要考虑。此时选择5955WX非常合适，单核性能强、PCIe lane数量多（单路主板可以有6条全速PCIe x16 slot），还能让所有GPU实现最高效的PCIe P2P连接。需要指出的是，5955WX平台并不贵，5955WX+M12SWA+8*32GB DDR4 3200也就1.5万元。

作者
Author: Entropy.S.I 时间: 2023-6-7 23:44
本帖最后由 Entropy.S.I 于 2023-6-8 02:17 编辑

Sun-2022 发表于 2023-6-7 23:38
力场应该是用ReaxFF

不建议用4090，应该用二手P100、V100 16G或TITAN V，具体请看我上面提到的文章。P100现在价格1000多元；V100 16G和TITAN V现在价格3000~4000元，TITAN V更便宜一些。

V100 16G、TITAN V的性能与V100 PCIe 32G几乎相同，区别只有VRAM大小，这对于MD模拟来说几乎没有影响。看我发的表格，V100 PCIe 32G跑ReaxFF的性能明显强于RTX4090，所以对你们来说性价比极高。

既然已经确认使用ReaxFF，那么专门再买一台纯CPU机是毫无必要的，一块1000多元的P100就能超越数万元的双路CPU机器。如果你对单个模拟的速度要求比较高，应该使用PCIe lane充足的平台，以便使用多卡运行1个模拟，参考上面提到的5955WX + M12SWA + 8*32GB DDR4 3200，这套平台1.5万元，可以配6块V100 16G或TITAN V，就算4000元一片，再算上机箱、电源、2*2TB PCIe4.0 NVMe SSD RAID1以及若干18TB HDD的价格，整套平台最多不超过4.5万。剩下1.5万，能留着就留着。

至于采购方式，找经销商配好整机，不必担心报销的问题。

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