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标题: 分子动力学模拟拓扑文件中的resp电荷问题 [打印本页]

作者
Author: tym1999 时间: 2023-6-11 11:39
标题: 分子动力学模拟拓扑文件中的resp电荷问题

关于获得resp电荷有几个问题想问：
1.采用mol2文件通过在线acpype网站下载的itp文件中的电荷需要替换为自己通过Multiwfn计算的resp电荷吗？
2.如果模拟是萃取体系（水-有机相体系），溶质会在不同阶段溶于水和有机相，计算溶质resp2电荷的溶剂是使用水吗？
3.如果两种物质互溶（属于在一定温度下互溶形成低共熔化合物，不存在严格的溶质溶剂的情况），计算resp2电荷的溶剂是互为对方吗？如果这两种物质作为溶剂Gaussian中都没有内置，需要自己定义溶剂的参数吗？如果用一些相似物质代替成为溶剂，会对最后resp电荷的产生结果有很大的影响吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-6-11 14:04
1 建议如此

2 相对公平的做法是定义混合溶剂，水和有机溶剂的介电常数按数密度比例取平均

3 自定义溶剂

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