标题: 探针分子检测物质前后分子结构扭转问题求助 [打印本页] 作者Author: 往往123 时间: 2023-6-12 11:15 标题: 探针分子检测物质前后分子结构扭转问题求助 我的理论计算是在别人实验(https://doi.org/10.1016/j.saa.2022.121619)基础上进行的理论计算,探针分子(PBQ)结构如图所示:
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,与检测物质光气反应后结构如图所示:
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。这是一个比率式的荧光探针,作者引用别人文献解释道:光气引起的酰胺化产生PBQ不利于T*发射。Klymchenko等人以前也报道过类似的现象。仲胺取代可将苯环扭曲出喹诺酮平面。不太平坦的构象可以有效地关闭ESIPT过程。我找到这篇文献,文献解释说:探针分子未检测前,3-羟基和2-苯基部分之间的相互作用大大限制了羟基的旋转运动,ESIPT反应较快。检测后探针分子空间效应降低了染料的平面性,使得3-OH基团具有更大的旋转自由度,ESIPT反应较慢。
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我探究了不同极性溶剂条件下(隐式溶剂模型:iefpcm)探针分子及其与光气分子反应后分子结构的变化,势能曲线显示,质子转移发生在激发态,我分别选取了氯仿、四氢呋喃、二氯甲烷、甲醇四种溶剂。优化基态及激发态结构,探针分子检测前后在基态和激发态二面角角度如图:
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,按实验文章说探针分子反应后应该是3-羟基的旋转自由度要大,二面角相对于反应前应该更大,到甲醇,探针分子反应后二面角为27.07,反应前为-27.60,和前面解释的不符,想问问各位大佬,是哪里出问题了嘛。
我所有的优化
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都基于PBE0泛函,TZVP机组。探针分子基态优化初始结构:
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,激发态优化初始结构。
与光气反应后基态初始结构:,激发态初始结构:
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